More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1644 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1644  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
192 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1637  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  98.44 
 
 
192 aa  381  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47067  predicted protein  48.65 
 
 
1237 aa  187  8e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.375267  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.37 
 
 
313 aa  178  4.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1657  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.24 
 
 
221 aa  175  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.74 
 
 
202 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.45 
 
 
214 aa  161  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.39 
 
 
227 aa  160  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877023 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002780  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.35 
 
 
220 aa  158  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0763  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, putative  44.39 
 
 
186 aa  157  6e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.211527  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.68 
 
 
219 aa  156  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.09 
 
 
219 aa  156  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1063  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.19 
 
 
212 aa  156  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.09 
 
 
219 aa  155  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1102  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.36 
 
 
214 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0126  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.71 
 
 
198 aa  154  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.86 
 
 
222 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2993  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.19 
 
 
212 aa  152  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1630  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.78 
 
 
214 aa  152  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1129  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.31 
 
 
214 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.36 
 
 
211 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.02 
 
 
223 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0643  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.08 
 
 
217 aa  149  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104742  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.93 
 
 
216 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1872  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.22 
 
 
222 aa  149  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.46 
 
 
222 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.15 
 
 
205 aa  149  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03201  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.51 
 
 
212 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.24 
 
 
212 aa  148  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.24 
 
 
212 aa  148  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.24 
 
 
212 aa  148  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.94 
 
 
210 aa  148  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.3 
 
 
215 aa  147  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1407  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.53 
 
 
202 aa  147  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1281  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.76 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.15 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1574  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.18 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.43 
 
 
206 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192447  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1446  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.38 
 
 
218 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2381  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.14 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0156868  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2453  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.14 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0349529  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.18 
 
 
220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2546  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.14 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000131759  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2098  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.57 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.545159  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02149  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.76 
 
 
216 aa  145  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1729  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.57 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000874228  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1772  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.57 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000685362  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1734  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.57 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000105531  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2550  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.57 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000126905  hitchhiker  0.000000000223078 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0641  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.25 
 
 
208 aa  145  5e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.6 
 
 
212 aa  144  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1967  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.52 
 
 
236 aa  144  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0964  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.11 
 
 
218 aa  144  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597426 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.57 
 
 
206 aa  143  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1812  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.23 
 
 
202 aa  143  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4633  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.66 
 
 
239 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614886  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.77 
 
 
209 aa  143  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2761  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.89 
 
 
214 aa  143  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.22 
 
 
214 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.07 
 
 
212 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.57 
 
 
205 aa  143  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1595  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44 
 
 
214 aa  143  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000272068  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.37 
 
 
245 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1512  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.57 
 
 
214 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000374503  normal  0.459598 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0999  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.89 
 
 
194 aa  142  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.797413  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0478  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.15 
 
 
212 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.58 
 
 
225 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.37 
 
 
206 aa  142  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000116567  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40 
 
 
204 aa  142  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0319  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.89 
 
 
232 aa  141  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.0027967  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.64 
 
 
224 aa  141  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2609  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40 
 
 
225 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09921  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.3 
 
 
232 aa  141  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.337887 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0039  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.89 
 
 
225 aa  141  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.6 
 
 
220 aa  141  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.81 
 
 
221 aa  140  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.7 
 
 
203 aa  140  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.64 
 
 
208 aa  140  9e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.147128  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0515  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.59 
 
 
226 aa  140  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.549179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3853  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.36 
 
 
220 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2182  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.69 
 
 
207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.83 
 
 
218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5548  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.53 
 
 
220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0576  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.5 
 
 
221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.116598 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0524  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.47 
 
 
204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.53 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992946 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.36 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.36 
 
 
222 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2745  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.43 
 
 
214 aa  139  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000377179  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1598  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.36 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.718303  normal  0.398382 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2703  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.56 
 
 
225 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00267955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.74 
 
 
213 aa  138  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2391  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.86 
 
 
214 aa  138  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.11 
 
 
225 aa  138  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.364169  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2578  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.29 
 
 
214 aa  136  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0668688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1632  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.59 
 
 
216 aa  136  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0554809 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.1 
 
 
214 aa  137  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.259794  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0599  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40 
 
 
526 aa  136  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2869  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.7 
 
 
212 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3468  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.24 
 
 
207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>