More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1967 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1967  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
236 aa  473  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.81 
 
 
219 aa  248  8e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.31 
 
 
219 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.31 
 
 
219 aa  240  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5548  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.74 
 
 
220 aa  239  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1574  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.41 
 
 
229 aa  236  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1094  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.96 
 
 
223 aa  235  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.538676  hitchhiker  0.0026309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.95 
 
 
214 aa  232  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.78 
 
 
222 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1240  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.05 
 
 
223 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000502279 
 
 
-
 
NC_004310  BR0709  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.11 
 
 
205 aa  221  8e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.11 
 
 
205 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.61 
 
 
224 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5165  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.11 
 
 
218 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820799  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3853  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.41 
 
 
220 aa  218  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.73 
 
 
216 aa  218  7.999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992946 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.03 
 
 
216 aa  218  8.999999999999998e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0791  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.69 
 
 
220 aa  217  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277928  normal  0.560587 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2538  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.68 
 
 
206 aa  216  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0490  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.5 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.65 
 
 
209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2577  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.54 
 
 
205 aa  208  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.829885  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0964  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.52 
 
 
218 aa  207  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597426 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.23 
 
 
220 aa  207  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1899  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51 
 
 
220 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2510  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51 
 
 
220 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2488  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.67 
 
 
218 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.062829  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5842  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51 
 
 
220 aa  205  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.12 
 
 
222 aa  205  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.5 
 
 
221 aa  205  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2535  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51 
 
 
220 aa  204  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0808214 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0236  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.6 
 
 
212 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.822796 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0785  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51 
 
 
220 aa  203  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160821 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2428  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.5 
 
 
220 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  hitchhiker  0.000000443644 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2956  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.87 
 
 
215 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.502503  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2557  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.5 
 
 
220 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0763  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, putative  54.3 
 
 
186 aa  202  3e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.211527  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0764  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.4 
 
 
203 aa  201  6e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
217 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0576  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
221 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.116598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3462  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.35 
 
 
217 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19888  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
212 aa  197  7.999999999999999e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0515  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.98 
 
 
226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.549179 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1598  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.38 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.718303  normal  0.398382 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0073  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.96 
 
 
219 aa  196  3e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0913  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.53 
 
 
210 aa  195  5.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.23 
 
 
208 aa  191  7e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.147128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.95 
 
 
214 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.79 
 
 
213 aa  189  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.6 
 
 
220 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.73 
 
 
205 aa  189  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0641  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.72 
 
 
208 aa  188  5.999999999999999e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.24 
 
 
215 aa  187  9e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0740  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.94 
 
 
209 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1477  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.32 
 
 
200 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1063  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.96 
 
 
212 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1824  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.49 
 
 
218 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00661254  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0898  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.32 
 
 
195 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.414511  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.44 
 
 
222 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.5 
 
 
216 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.92 
 
 
222 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1275  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.61 
 
 
198 aa  185  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2544  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.12 
 
 
193 aa  184  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.715033  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.6 
 
 
210 aa  184  9e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.57 
 
 
218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.34 
 
 
212 aa  182  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.34 
 
 
212 aa  182  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.34 
 
 
212 aa  182  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.59 
 
 
211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4054  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.88 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1664  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.4 
 
 
217 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278539  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02149  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.3 
 
 
216 aa  181  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.64 
 
 
209 aa  182  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47 
 
 
216 aa  181  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.826865  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1896  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.92 
 
 
219 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1572  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.92 
 
 
219 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481989 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1570  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.92 
 
 
219 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000536598 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5372  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.17 
 
 
192 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.421212 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2666  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.18 
 
 
213 aa  180  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.54 
 
 
211 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.226239  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.88 
 
 
217 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0643  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.46 
 
 
217 aa  180  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104742  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.92 
 
 
245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.19 
 
 
203 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1456  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.13 
 
 
209 aa  179  4.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.551821 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.72 
 
 
223 aa  178  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2325  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.1 
 
 
218 aa  177  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.598595  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1976  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.18 
 
 
208 aa  177  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1776  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.5 
 
 
213 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000344484  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3525  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.81 
 
 
212 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0302516  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1632  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.56 
 
 
216 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0554809 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3391  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.11 
 
 
194 aa  176  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2729  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.11 
 
 
194 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2333  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.5 
 
 
216 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal  0.274367 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.59 
 
 
205 aa  176  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0033  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.54 
 
 
192 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519316  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.79 
 
 
206 aa  175  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192447  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.11 
 
 
205 aa  175  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.400719 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.99 
 
 
203 aa  175  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.5 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>