More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0126 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0126  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
198 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1531  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  75.13 
 
 
197 aa  296  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.468098  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.26 
 
 
202 aa  195  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1477  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.26 
 
 
200 aa  194  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.61 
 
 
205 aa  194  8.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.06 
 
 
211 aa  191  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.53 
 
 
203 aa  188  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.83 
 
 
215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.62 
 
 
204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.09 
 
 
204 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.26 
 
 
227 aa  178  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877023 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.04 
 
 
206 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.13 
 
 
206 aa  177  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.12 
 
 
206 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000116567  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1812  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.9 
 
 
202 aa  177  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1890  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.72 
 
 
213 aa  175  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.505321 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.08 
 
 
218 aa  175  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.17 
 
 
214 aa  175  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.2 
 
 
206 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192447  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1776  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.06 
 
 
213 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000344484  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.94 
 
 
209 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1976  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.34 
 
 
208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1630  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.4 
 
 
214 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0964  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.53 
 
 
218 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597426 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.17 
 
 
220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.08 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.46 
 
 
214 aa  171  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.45 
 
 
205 aa  171  9e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2609  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.94 
 
 
225 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1281  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.88 
 
 
195 aa  170  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.95 
 
 
220 aa  170  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.4 
 
 
216 aa  169  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.2 
 
 
212 aa  169  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2703  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.45 
 
 
225 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00267955  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1824  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.11 
 
 
218 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00661254  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0643  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.75 
 
 
217 aa  169  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.94 
 
 
225 aa  168  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5548  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.26 
 
 
220 aa  168  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0532  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.89 
 
 
202 aa  167  7e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00415647  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.94 
 
 
222 aa  167  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.81 
 
 
216 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.826865  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.28 
 
 
224 aa  166  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.4 
 
 
217 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.32 
 
 
222 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0709  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.66 
 
 
205 aa  165  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.06 
 
 
211 aa  165  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.226239  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1417  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.65 
 
 
205 aa  165  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000602325  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.66 
 
 
205 aa  165  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1664  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.88 
 
 
217 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278539  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1574  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.94 
 
 
229 aa  165  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2538  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.47 
 
 
206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2113  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.28 
 
 
249 aa  164  8e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0763  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, putative  43.85 
 
 
186 aa  164  1.0000000000000001e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.211527  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.28 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36900  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.11 
 
 
215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2333  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.81 
 
 
216 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal  0.274367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4054  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.35 
 
 
217 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.34 
 
 
245 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.24 
 
 
313 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0236  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.73 
 
 
212 aa  162  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.822796 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
216 aa  162  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3525  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.68 
 
 
212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0302516  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1486  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.33 
 
 
206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000112239  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.72 
 
 
205 aa  161  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.400719 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1572  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.09 
 
 
219 aa  161  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481989 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1570  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.09 
 
 
219 aa  161  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000536598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.77 
 
 
219 aa  161  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1896  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.09 
 
 
219 aa  161  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0326  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.62 
 
 
195 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.62 
 
 
195 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0269  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.62 
 
 
195 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.62 
 
 
195 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2666  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.15 
 
 
213 aa  160  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2544  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.2 
 
 
193 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.715033  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0343  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.09 
 
 
195 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0297  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.62 
 
 
195 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.55 
 
 
212 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5372  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.08 
 
 
192 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.421212 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2989  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.09 
 
 
213 aa  160  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0329  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.62 
 
 
195 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2869  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.09 
 
 
212 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.22 
 
 
219 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02392  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.55 
 
 
212 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.67 
 
 
219 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3853  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.66 
 
 
220 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2783  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.55 
 
 
212 aa  159  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.154299  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2874  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.55 
 
 
212 aa  159  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.551814  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1176  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.55 
 
 
212 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02354  hypothetical protein  42.55 
 
 
212 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110228  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2635  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.55 
 
 
212 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.97 
 
 
222 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2391  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.54 
 
 
214 aa  159  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.45 
 
 
210 aa  159  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.99 
 
 
216 aa  159  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992946 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0726  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.25 
 
 
196 aa  159  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000428099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.07 
 
 
217 aa  158  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923837  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1632  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.33 
 
 
216 aa  158  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0554809 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4977  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.09 
 
 
195 aa  158  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1094  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.74 
 
 
223 aa  158  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.538676  hitchhiker  0.0026309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3723  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.55 
 
 
212 aa  158  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.160201  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>