More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2538 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2538  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
206 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0236  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  72.22 
 
 
212 aa  270  8.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.822796 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  65.57 
 
 
219 aa  228  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  65.08 
 
 
219 aa  228  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  65.57 
 
 
219 aa  228  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.09 
 
 
222 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2544  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  64.55 
 
 
193 aa  226  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.715033  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1967  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.68 
 
 
236 aa  225  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0709  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.21 
 
 
205 aa  216  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.14 
 
 
216 aa  216  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.21 
 
 
205 aa  215  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1094  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.04 
 
 
223 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.538676  hitchhiker  0.0026309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3853  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.89 
 
 
220 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0964  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.67 
 
 
218 aa  209  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3462  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.89 
 
 
217 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19888  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.28 
 
 
214 aa  209  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.64 
 
 
216 aa  207  7e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992946 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1574  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.85 
 
 
229 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5548  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.79 
 
 
220 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1240  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.41 
 
 
223 aa  205  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000502279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2956  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.12 
 
 
215 aa  204  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.502503  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.84 
 
 
224 aa  204  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1598  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.17 
 
 
217 aa  202  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.718303  normal  0.398382 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2488  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.37 
 
 
218 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.062829  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.01 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0033  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.15 
 
 
192 aa  199  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519316  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.76 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0764  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.78 
 
 
203 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.91 
 
 
209 aa  193  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.38 
 
 
220 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.37 
 
 
227 aa  192  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877023 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1570  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.2 
 
 
219 aa  191  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000536598 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1572  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.2 
 
 
219 aa  191  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481989 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1896  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.2 
 
 
219 aa  191  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.26 
 
 
209 aa  191  7e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.22 
 
 
212 aa  191  8e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2577  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.06 
 
 
205 aa  190  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.829885  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1888  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.06 
 
 
197 aa  189  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00391405  normal  0.23878 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.48 
 
 
222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.86 
 
 
211 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.226239  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0740  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.5 
 
 
209 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.79 
 
 
221 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0490  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.93 
 
 
216 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5165  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.84 
 
 
218 aa  185  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820799  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.09 
 
 
203 aa  185  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.45 
 
 
217 aa  185  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1456  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.37 
 
 
209 aa  184  9e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.551821 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.74 
 
 
211 aa  184  9e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.74 
 
 
216 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.87 
 
 
213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.09 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0576  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.16 
 
 
221 aa  182  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.116598 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1758  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.45 
 
 
315 aa  181  9.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.2 
 
 
204 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.83 
 
 
206 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192447  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.67 
 
 
210 aa  180  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.46 
 
 
204 aa  179  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0791  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.61 
 
 
220 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277928  normal  0.560587 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0641  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.19 
 
 
208 aa  179  4e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0898  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.44 
 
 
195 aa  178  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.414511  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1275  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.79 
 
 
198 aa  178  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5372  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.61 
 
 
192 aa  178  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.421212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.16 
 
 
216 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.826865  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1824  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.38 
 
 
218 aa  178  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00661254  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1475  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.29 
 
 
184 aa  177  8e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.194881  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.6 
 
 
245 aa  177  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3927  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.17 
 
 
198 aa  177  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.43 
 
 
214 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1776  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.46 
 
 
213 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000344484  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.6 
 
 
212 aa  176  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.6 
 
 
212 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2609  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.98 
 
 
225 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.6 
 
 
212 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.05 
 
 
214 aa  176  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.259794  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3843  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.23 
 
 
199 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0791842  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0515  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
226 aa  176  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.549179 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2666  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.75 
 
 
213 aa  175  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2703  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.24 
 
 
225 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00267955  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2333  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.63 
 
 
216 aa  175  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal  0.274367 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1649  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.08 
 
 
197 aa  174  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318783  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1837  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.3 
 
 
197 aa  174  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.117962 
 
 
-
 
NC_002978  WD0763  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, putative  45.16 
 
 
186 aa  173  9.999999999999999e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.211527  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.98 
 
 
225 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.73 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.364169  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.05 
 
 
208 aa  173  9.999999999999999e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.147128  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3391  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.72 
 
 
194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2729  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.72 
 
 
194 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.5 
 
 
206 aa  171  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1899  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.75 
 
 
220 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2510  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.75 
 
 
220 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2325  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.91 
 
 
218 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.598595  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5842  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.11 
 
 
220 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2535  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.75 
 
 
220 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0808214 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0643  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.55 
 
 
217 aa  170  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104742  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.48 
 
 
205 aa  170  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0678  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.88 
 
 
196 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1477  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.13 
 
 
200 aa  169  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.24 
 
 
198 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0785  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.58 
 
 
220 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.3 
 
 
206 aa  169  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>