More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0678 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0678  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
196 aa  381  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1970  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  97.8 
 
 
182 aa  346  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3067  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  88.21 
 
 
196 aa  321  5e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1888  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  78.35 
 
 
197 aa  301  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00391405  normal  0.23878 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3927  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  77.44 
 
 
198 aa  284  5e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1837  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  73.71 
 
 
197 aa  283  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.117962 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1475  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  66.12 
 
 
184 aa  237  6.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.194881  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.61 
 
 
214 aa  204  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2729  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.07 
 
 
194 aa  200  9e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5372  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.07 
 
 
192 aa  200  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.421212 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3391  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.07 
 
 
194 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36900  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.1 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.74 
 
 
205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1094  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.45 
 
 
223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.538676  hitchhiker  0.0026309 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.25 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.14 
 
 
209 aa  194  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0709  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.21 
 
 
205 aa  194  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3843  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.38 
 
 
199 aa  193  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0791842  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1574  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.37 
 
 
229 aa  193  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0893  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.94 
 
 
219 aa  192  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000873186 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.21 
 
 
245 aa  192  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.32 
 
 
212 aa  192  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.32 
 
 
212 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.32 
 
 
212 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.6 
 
 
198 aa  192  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.15 
 
 
222 aa  192  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1240  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.17 
 
 
223 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000502279 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0740  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.84 
 
 
209 aa  191  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0898  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.84 
 
 
195 aa  191  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.414511  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.14 
 
 
219 aa  191  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1632  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.63 
 
 
216 aa  191  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0554809 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3437  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.08 
 
 
192 aa  190  9e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.333291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1664  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.55 
 
 
217 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278539  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1063  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.23 
 
 
212 aa  190  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0236  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.68 
 
 
212 aa  190  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.822796 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.85 
 
 
224 aa  190  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4054  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.55 
 
 
217 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.59 
 
 
219 aa  190  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.76 
 
 
222 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.55 
 
 
217 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.19 
 
 
216 aa  189  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992946 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.19 
 
 
213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0791  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.19 
 
 
220 aa  187  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277928  normal  0.560587 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.81 
 
 
215 aa  187  9e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0964  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.89 
 
 
218 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597426 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.23 
 
 
220 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.61 
 
 
217 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923837  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1899  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.5 
 
 
220 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2510  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.5 
 
 
220 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.15 
 
 
222 aa  185  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2535  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.5 
 
 
220 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0808214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.17 
 
 
222 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.5 
 
 
217 aa  185  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5842  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.5 
 
 
220 aa  184  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.79 
 
 
214 aa  185  5e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.259794  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1649  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.66 
 
 
197 aa  184  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318783  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1275  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.89 
 
 
198 aa  185  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3690  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.58 
 
 
216 aa  184  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.864702  decreased coverage  0.000250374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.97 
 
 
221 aa  184  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1824  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.22 
 
 
218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00661254  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002780  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.22 
 
 
220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0033  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.74 
 
 
192 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519316  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1758  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.26 
 
 
315 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0576  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.26 
 
 
221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.116598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5548  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.68 
 
 
220 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2544  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.15 
 
 
193 aa  183  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.715033  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2578  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.35 
 
 
214 aa  182  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0668688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2428  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.44 
 
 
220 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  hitchhiker  0.000000443644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2557  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.44 
 
 
220 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0785  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.97 
 
 
220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160821 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.38 
 
 
216 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.826865  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.8 
 
 
214 aa  181  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.34 
 
 
220 aa  181  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2098  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.34 
 
 
212 aa  181  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.545159  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2993  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.56 
 
 
212 aa  181  8.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3525  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.74 
 
 
212 aa  181  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0302516  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1451  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.27 
 
 
214 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00170053  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1512  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.73 
 
 
214 aa  180  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000374503  normal  0.459598 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.85 
 
 
216 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1699  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
216 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26745  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.74 
 
 
209 aa  179  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2101  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.59 
 
 
207 aa  179  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388501  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2333  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.85 
 
 
216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal  0.274367 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0764  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.55 
 
 
203 aa  177  5.999999999999999e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02149  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.68 
 
 
216 aa  178  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2490  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.19 
 
 
218 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135509  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2869  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.53 
 
 
212 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2666  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.76 
 
 
213 aa  176  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2989  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.15 
 
 
213 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2761  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
214 aa  175  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2577  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.76 
 
 
205 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.829885  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.43 
 
 
212 aa  175  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2696  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
212 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2381  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
214 aa  175  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0156868  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2453  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
214 aa  175  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0349529  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2546  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
214 aa  175  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000131759  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
212 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2745  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.13 
 
 
214 aa  174  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000377179  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
212 aa  174  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.73 
 
 
220 aa  174  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>