More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1837 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1837  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
197 aa  398  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.117962 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1888  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  72.08 
 
 
197 aa  281  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00391405  normal  0.23878 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0678  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  73.71 
 
 
196 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3067  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  72.68 
 
 
196 aa  268  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1970  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  71.43 
 
 
182 aa  258  6e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3927  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  68.56 
 
 
198 aa  253  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1475  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.87 
 
 
184 aa  218  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.194881  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0236  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.61 
 
 
212 aa  194  8.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.822796 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.11 
 
 
214 aa  191  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.69 
 
 
222 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.15 
 
 
222 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.72 
 
 
245 aa  186  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5372  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.21 
 
 
192 aa  185  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.421212 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.79 
 
 
205 aa  185  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0893  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.6 
 
 
219 aa  184  9e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000873186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5548  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.56 
 
 
220 aa  184  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.87 
 
 
216 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0709  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.28 
 
 
205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1094  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.01 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.538676  hitchhiker  0.0026309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1632  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
216 aa  182  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0554809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.55 
 
 
219 aa  182  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0964  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.6 
 
 
218 aa  182  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597426 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2666  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.32 
 
 
213 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2544  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.5 
 
 
193 aa  182  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.715033  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0033  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.83 
 
 
192 aa  181  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519316  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36900  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.98 
 
 
215 aa  181  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2729  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.4 
 
 
194 aa  181  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3391  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.7 
 
 
194 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.84 
 
 
223 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0898  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.12 
 
 
195 aa  180  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.414511  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4054  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.69 
 
 
217 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.48 
 
 
209 aa  179  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.44 
 
 
222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.7 
 
 
219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3843  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.59 
 
 
199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0791842  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3462  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.04 
 
 
217 aa  178  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19888  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.7 
 
 
219 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1275  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.89 
 
 
198 aa  178  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.74 
 
 
214 aa  177  7e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.259794  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1240  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.58 
 
 
223 aa  177  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000502279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.69 
 
 
217 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.34 
 
 
224 aa  176  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02149  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.48 
 
 
216 aa  176  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1574  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
229 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0490  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.92 
 
 
216 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.41 
 
 
198 aa  175  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0740  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.03 
 
 
209 aa  175  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1664  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.61 
 
 
217 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278539  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.11 
 
 
222 aa  175  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.13 
 
 
212 aa  174  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.13 
 
 
212 aa  174  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.13 
 
 
212 aa  174  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3853  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.53 
 
 
220 aa  174  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3690  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.54 
 
 
216 aa  174  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.864702  decreased coverage  0.000250374 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1824  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.11 
 
 
218 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00661254  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.27 
 
 
217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.01 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1699  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.46 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26745  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.13 
 
 
210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.21 
 
 
214 aa  171  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0785  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.74 
 
 
220 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160821 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2333  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.08 
 
 
216 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal  0.274367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3437  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.63 
 
 
192 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.333291 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1598  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.58 
 
 
217 aa  170  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.718303  normal  0.398382 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2557  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.7 
 
 
220 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2428  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.7 
 
 
220 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  hitchhiker  0.000000443644 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.64 
 
 
220 aa  169  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.37 
 
 
220 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.8 
 
 
221 aa  168  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2535  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.7 
 
 
220 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0808214 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1899  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.7 
 
 
220 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.54 
 
 
216 aa  168  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.826865  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2510  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.7 
 
 
220 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2098  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.95 
 
 
212 aa  168  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.545159  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1729  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.87 
 
 
214 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000874228  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1734  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.87 
 
 
214 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000105531  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2550  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.87 
 
 
214 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000126905  hitchhiker  0.000000000223078 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.72 
 
 
220 aa  167  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1772  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.87 
 
 
214 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000685362  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0791  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.8 
 
 
220 aa  167  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277928  normal  0.560587 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1758  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.26 
 
 
315 aa  167  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
216 aa  167  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.03 
 
 
213 aa  167  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2956  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.31 
 
 
215 aa  167  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.502503  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.61 
 
 
217 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923837  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2381  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.21 
 
 
214 aa  167  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0156868  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2453  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.21 
 
 
214 aa  167  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0349529  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2546  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.21 
 
 
214 aa  167  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000131759  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5842  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.7 
 
 
220 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.44 
 
 
211 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.226239  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.44 
 
 
217 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0913  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.65 
 
 
210 aa  166  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.95 
 
 
215 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2745  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.79 
 
 
214 aa  166  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000377179  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.42 
 
 
212 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5165  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.89 
 
 
218 aa  165  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820799  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2490  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.11 
 
 
218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135509  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0764  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.93 
 
 
203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1595  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.31 
 
 
214 aa  164  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000272068  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2578  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.81 
 
 
214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0668688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>