More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1758 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1758  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
315 aa  637    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0033  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  67.03 
 
 
192 aa  252  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519316  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0898  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.58 
 
 
195 aa  243  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.414511  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1888  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.4 
 
 
197 aa  193  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00391405  normal  0.23878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.01 
 
 
219 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5548  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.55 
 
 
220 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.01 
 
 
219 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.01 
 
 
219 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2544  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.55 
 
 
193 aa  182  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.715033  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.64 
 
 
216 aa  179  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992946 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.83 
 
 
214 aa  176  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0678  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.26 
 
 
196 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.56 
 
 
222 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0964  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.9 
 
 
218 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597426 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.65 
 
 
222 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.59 
 
 
245 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3927  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.03 
 
 
198 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2538  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.45 
 
 
206 aa  169  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1970  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.85 
 
 
182 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3067  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.06 
 
 
196 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.15 
 
 
209 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1837  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.26 
 
 
197 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.117962 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0236  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.18 
 
 
212 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.822796 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5165  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.01 
 
 
218 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820799  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.2 
 
 
220 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.95 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1475  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.55 
 
 
184 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.194881  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.6 
 
 
205 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0709  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.6 
 
 
205 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.74 
 
 
221 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0576  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.3 
 
 
221 aa  162  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.116598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3853  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.74 
 
 
220 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.05 
 
 
224 aa  162  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.33 
 
 
217 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02149  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.24 
 
 
216 aa  162  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.27 
 
 
216 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.826865  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3462  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.96 
 
 
217 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19888  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1094  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
223 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.538676  hitchhiker  0.0026309 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.93 
 
 
215 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.67 
 
 
213 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.51 
 
 
216 aa  160  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.78 
 
 
212 aa  158  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3391  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.31 
 
 
194 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0490  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.1 
 
 
216 aa  155  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.67 
 
 
214 aa  155  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.37 
 
 
214 aa  155  7e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.259794  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0740  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.79 
 
 
209 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3843  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.06 
 
 
199 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0791842  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2333  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.02 
 
 
216 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal  0.274367 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.89 
 
 
220 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1240  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.35 
 
 
223 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000502279 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.28 
 
 
209 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.96 
 
 
220 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2729  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.75 
 
 
194 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1275  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.11 
 
 
198 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1824  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.18 
 
 
218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00661254  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.79 
 
 
198 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5372  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.86 
 
 
192 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.421212 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1967  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.11 
 
 
236 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2535  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.65 
 
 
220 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0808214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3690  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.52 
 
 
216 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.864702  decreased coverage  0.000250374 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1899  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.65 
 
 
220 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2510  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.65 
 
 
220 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1632  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.02 
 
 
216 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0554809 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5842  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.11 
 
 
220 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0515  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.45 
 
 
226 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.549179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.31 
 
 
217 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923837  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0893  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.2 
 
 
219 aa  152  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000873186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.2 
 
 
222 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.54 
 
 
212 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.86 
 
 
212 aa  151  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.86 
 
 
212 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1456  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.28 
 
 
209 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.551821 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.86 
 
 
212 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2098  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.81 
 
 
212 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.545159  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1664  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.51 
 
 
217 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278539  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2666  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.11 
 
 
213 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.43 
 
 
211 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.226239  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4054  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.51 
 
 
217 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.51 
 
 
217 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0785  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.11 
 
 
220 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160821 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0913  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.43 
 
 
210 aa  149  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2993  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.5 
 
 
212 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1063  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.65 
 
 
212 aa  150  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2428  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.57 
 
 
220 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  hitchhiker  0.000000443644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2557  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.57 
 
 
220 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.38 
 
 
222 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1598  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.37 
 
 
217 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.718303  normal  0.398382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2578  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.93 
 
 
214 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0668688  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2490  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.94 
 
 
218 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135509  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.43 
 
 
223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.41 
 
 
217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2381  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.37 
 
 
214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0156868  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2453  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.37 
 
 
214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0349529  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2546  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.37 
 
 
214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000131759  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0764  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.97 
 
 
203 aa  147  3e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1595  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.25 
 
 
214 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000272068  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3437  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.95 
 
 
192 aa  146  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.333291 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1772  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.81 
 
 
214 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000685362  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2550  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.81 
 
 
214 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000126905  hitchhiker  0.000000000223078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>