More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1281 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1281  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
195 aa  401  1e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.06 
 
 
204 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.42 
 
 
211 aa  198  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.55 
 
 
204 aa  197  9e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.48 
 
 
203 aa  195  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.72 
 
 
206 aa  187  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.73 
 
 
206 aa  184  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.04 
 
 
206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192447  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4633  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.59 
 
 
239 aa  182  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614886  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.27 
 
 
218 aa  181  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.2 
 
 
220 aa  180  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.63 
 
 
202 aa  178  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1102  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.99 
 
 
214 aa  178  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1129  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.45 
 
 
214 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.15 
 
 
205 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0478  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.28 
 
 
212 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0039  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.37 
 
 
225 aa  176  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2609  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.42 
 
 
225 aa  175  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.95 
 
 
225 aa  175  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2703  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.92 
 
 
225 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00267955  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.07 
 
 
206 aa  174  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1657  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.03 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0236  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.35 
 
 
212 aa  171  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.822796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0564  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.99 
 
 
218 aa  170  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513649  normal  0.0898016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.06 
 
 
222 aa  170  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1138  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.68 
 
 
210 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0126  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.88 
 
 
198 aa  170  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1477  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.7 
 
 
200 aa  170  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0958  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.28 
 
 
209 aa  169  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.779009  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.61 
 
 
205 aa  169  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.400719 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1630  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.59 
 
 
214 aa  169  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1417  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.31 
 
 
205 aa  168  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000602325  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04220  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, formyltetrahydrofolate-dependent  44.39 
 
 
212 aa  167  6e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.89 
 
 
227 aa  167  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877023 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1063  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.05 
 
 
212 aa  166  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4900  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.85 
 
 
410 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367196 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02149  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.78 
 
 
216 aa  166  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2993  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.17 
 
 
212 aa  165  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.81 
 
 
225 aa  165  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.364169  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.49 
 
 
219 aa  164  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.16 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.93 
 
 
206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000116567  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.16 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.16 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.95 
 
 
219 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0343  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.27 
 
 
195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0326  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.11 
 
 
195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.11 
 
 
195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0269  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.11 
 
 
195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.11 
 
 
195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0297  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.11 
 
 
195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0329  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.11 
 
 
195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1776  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.89 
 
 
213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000344484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4977  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.36 
 
 
195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0272  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.11 
 
 
195 aa  162  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0276  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.27 
 
 
195 aa  162  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.49 
 
 
219 aa  162  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.54 
 
 
216 aa  162  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992946 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0726  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.1 
 
 
196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000428099  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1812  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.92 
 
 
202 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0278  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.24 
 
 
195 aa  161  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1976  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.81 
 
 
208 aa  160  8.000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01770  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.39 
 
 
201 aa  160  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.81 
 
 
223 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2513  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.42 
 
 
230 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114714 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0143  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40 
 
 
190 aa  160  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.27 
 
 
194 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02392  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.22 
 
 
212 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1176  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.22 
 
 
212 aa  159  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2783  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.22 
 
 
212 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.154299  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.22 
 
 
212 aa  159  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02354  hypothetical protein  42.22 
 
 
212 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110228  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.81 
 
 
222 aa  158  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2869  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.22 
 
 
212 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.48 
 
 
222 aa  158  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2635  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.22 
 
 
212 aa  158  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2874  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.22 
 
 
212 aa  158  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.551814  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.25 
 
 
214 aa  158  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0643  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.55 
 
 
217 aa  157  7e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3723  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.22 
 
 
212 aa  157  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.160201  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1169  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.67 
 
 
212 aa  157  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1531  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.35 
 
 
197 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.468098  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.78 
 
 
205 aa  157  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2760  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.67 
 
 
212 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.67 
 
 
212 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2696  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.67 
 
 
212 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1673  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.81 
 
 
198 aa  156  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0568966 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0999  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.33 
 
 
194 aa  156  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.797413  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1574  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.16 
 
 
229 aa  156  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.9 
 
 
212 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0709  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.59 
 
 
205 aa  155  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0319  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.15 
 
 
232 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.0027967  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.59 
 
 
205 aa  155  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09921  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40 
 
 
232 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.337887 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.89 
 
 
214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.02 
 
 
230 aa  154  9e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0394188  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0053  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.11 
 
 
184 aa  154  9e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.243956  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.39 
 
 
245 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002780  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.83 
 
 
220 aa  153  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2544  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.13 
 
 
193 aa  153  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.715033  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>