More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2391 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2391  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
214 aa  439  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002780  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  66.67 
 
 
220 aa  306  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03201  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.21 
 
 
212 aa  279  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.32 
 
 
212 aa  276  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2745  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  64.08 
 
 
214 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000377179  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2989  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.09 
 
 
213 aa  264  7e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2578  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.44 
 
 
214 aa  261  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0668688  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1512  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.44 
 
 
214 aa  261  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000374503  normal  0.459598 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2550  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.95 
 
 
214 aa  261  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000126905  hitchhiker  0.000000000223078 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1734  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.95 
 
 
214 aa  261  6e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000105531  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1729  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.95 
 
 
214 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000874228  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1772  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.95 
 
 
214 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000685362  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2381  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.44 
 
 
214 aa  260  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0156868  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2453  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.44 
 
 
214 aa  260  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0349529  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2546  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.44 
 
 
214 aa  260  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000131759  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1063  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.43 
 
 
212 aa  259  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.85 
 
 
212 aa  258  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.85 
 
 
212 aa  258  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.85 
 
 
212 aa  258  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.2 
 
 
213 aa  258  5.0000000000000005e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2874  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.72 
 
 
212 aa  258  6e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.551814  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2635  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.24 
 
 
212 aa  257  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02392  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.24 
 
 
212 aa  257  8e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02354  hypothetical protein  59.24 
 
 
212 aa  257  8e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2783  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.24 
 
 
212 aa  257  8e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.154299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1176  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.24 
 
 
212 aa  257  8e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1451  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.11 
 
 
214 aa  257  8e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00170053  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1169  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.77 
 
 
212 aa  256  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1632  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.71 
 
 
216 aa  256  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0554809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.77 
 
 
212 aa  256  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3723  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.24 
 
 
212 aa  255  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.160201  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2993  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.96 
 
 
212 aa  255  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3525  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.46 
 
 
212 aa  255  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0302516  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1068  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.56 
 
 
220 aa  254  5e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2760  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.29 
 
 
212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1595  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.49 
 
 
214 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000272068  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2696  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.29 
 
 
212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.29 
 
 
212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.29 
 
 
212 aa  252  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.69 
 
 
222 aa  252  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2095  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.19 
 
 
213 aa  252  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000370583  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2869  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.29 
 
 
212 aa  251  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4054  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.25 
 
 
217 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2490  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.17 
 
 
218 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135509  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2761  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60 
 
 
214 aa  251  6e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1664  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.77 
 
 
217 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278539  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.28 
 
 
217 aa  248  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1844  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.44 
 
 
214 aa  248  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000807934  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.77 
 
 
217 aa  248  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2098  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.77 
 
 
212 aa  246  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.545159  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.73 
 
 
222 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.46 
 
 
214 aa  242  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3188  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.5 
 
 
211 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1128  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60 
 
 
212 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.77 
 
 
217 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923837  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02149  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.25 
 
 
216 aa  237  8e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36900  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.77 
 
 
215 aa  235  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0073  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.7 
 
 
219 aa  231  5e-60  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0893  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.1 
 
 
219 aa  229  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000873186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1699  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.37 
 
 
216 aa  228  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3690  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.88 
 
 
216 aa  226  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.864702  decreased coverage  0.000250374 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0515  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.73 
 
 
226 aa  223  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.549179 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2113  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.29 
 
 
249 aa  220  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
215 aa  218  7.999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.94 
 
 
209 aa  214  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.63 
 
 
220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.5 
 
 
222 aa  210  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.25 
 
 
220 aa  207  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2428  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.74 
 
 
220 aa  207  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  hitchhiker  0.000000443644 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1899  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.24 
 
 
220 aa  207  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2557  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.74 
 
 
220 aa  207  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2510  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.24 
 
 
220 aa  207  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2535  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.24 
 
 
220 aa  207  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0808214 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0264  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.22 
 
 
215 aa  207  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1929  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.73 
 
 
215 aa  206  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5842  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.24 
 
 
220 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1824  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.57 
 
 
218 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00661254  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.26 
 
 
221 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.24 
 
 
223 aa  202  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.53 
 
 
245 aa  201  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0576  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
221 aa  201  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.116598 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.23 
 
 
216 aa  201  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.96 
 
 
217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.75 
 
 
214 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.259794  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0785  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.23 
 
 
220 aa  199  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160821 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.72 
 
 
216 aa  198  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.826865  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2333  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.69 
 
 
216 aa  197  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal  0.274367 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.34 
 
 
210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0740  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.96 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.78 
 
 
212 aa  191  6e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.5 
 
 
220 aa  188  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0643  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.75 
 
 
217 aa  187  7e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0772  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.24 
 
 
220 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1570  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.24 
 
 
219 aa  186  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000536598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1896  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.24 
 
 
219 aa  186  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1572  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.24 
 
 
219 aa  186  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481989 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0969  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.03 
 
 
220 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0973  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.03 
 
 
220 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.28 
 
 
224 aa  185  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1126  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.03 
 
 
220 aa  184  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>