More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2182 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2182  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
207 aa  420  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1247  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  71.36 
 
 
209 aa  318  3.9999999999999996e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000481744  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3468  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.17 
 
 
207 aa  235  4e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1446  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.88 
 
 
218 aa  226  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0524  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.51 
 
 
204 aa  204  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.26 
 
 
202 aa  189  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1812  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.85 
 
 
202 aa  187  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1872  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.15 
 
 
222 aa  184  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.29 
 
 
206 aa  184  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.34 
 
 
218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.25 
 
 
313 aa  183  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.34 
 
 
203 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.6 
 
 
206 aa  177  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192447  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.6 
 
 
215 aa  176  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.63 
 
 
206 aa  176  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.37 
 
 
204 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.41 
 
 
205 aa  176  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.9 
 
 
206 aa  175  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000116567  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.06 
 
 
214 aa  175  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.37 
 
 
204 aa  175  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.12 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.06 
 
 
205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0676  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.96 
 
 
204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0674  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.96 
 
 
204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.67 
 
 
222 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.18 
 
 
217 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4054  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.67 
 
 
217 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.18 
 
 
222 aa  167  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1664  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.15 
 
 
217 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278539  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.44 
 
 
216 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1890  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.57 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.505321 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02149  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.42 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01770  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43 
 
 
201 aa  165  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.75 
 
 
212 aa  165  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.95 
 
 
220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2208  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.95 
 
 
224 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.128407  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.35 
 
 
210 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.75 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.48 
 
 
216 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.826865  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0532  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.23 
 
 
202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00415647  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.43 
 
 
213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2333  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.51 
 
 
216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal  0.274367 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1976  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.16 
 
 
208 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0515  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.04 
 
 
226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.549179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.62 
 
 
214 aa  161  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1632  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.13 
 
 
216 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0554809 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0576  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.55 
 
 
221 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.116598 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0035  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.49 
 
 
204 aa  159  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.84 
 
 
205 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.400719 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0913  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.07 
 
 
210 aa  159  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.44 
 
 
220 aa  159  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.81 
 
 
217 aa  157  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1630  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.39 
 
 
214 aa  157  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.62 
 
 
222 aa  157  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0253  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.54 
 
 
229 aa  156  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1824  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.33 
 
 
218 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00661254  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1486  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.96 
 
 
206 aa  155  4e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000112239  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0726  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.17 
 
 
206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.303566  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.26 
 
 
221 aa  154  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3690  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.27 
 
 
216 aa  154  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.864702  decreased coverage  0.000250374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.5 
 
 
224 aa  154  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1699  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.59 
 
 
216 aa  153  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26745  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.1 
 
 
217 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923837  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.75 
 
 
209 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.58 
 
 
222 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2578  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.24 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0668688  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1657  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.71 
 
 
221 aa  150  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04220  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, formyltetrahydrofolate-dependent  40.7 
 
 
212 aa  149  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3760  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.24 
 
 
205 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234419  normal  0.638022 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0643  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.59 
 
 
217 aa  149  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104742  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.05 
 
 
203 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0039  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.34 
 
 
225 aa  149  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.21 
 
 
220 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.81 
 
 
212 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.71 
 
 
223 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1063  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.35 
 
 
212 aa  148  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0785  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.69 
 
 
220 aa  148  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160821 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36900  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.59 
 
 
215 aa  148  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1595  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.33 
 
 
214 aa  148  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000272068  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.72 
 
 
214 aa  147  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2490  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40 
 
 
218 aa  147  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135509  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002780  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.75 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.89 
 
 
219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1772  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.03 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000685362  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1729  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.03 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000874228  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.35 
 
 
225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.364169  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2761  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.03 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2550  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.03 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000126905  hitchhiker  0.000000000223078 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2666  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.8 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1734  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.03 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000105531  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1417  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.79 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000602325  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2381  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.03 
 
 
214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0156868  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2453  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.03 
 
 
214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0349529  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2546  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.03 
 
 
214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000131759  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2098  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.51 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.545159  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1068  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.82 
 
 
220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2535  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.26 
 
 
220 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0808214 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1407  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.29 
 
 
202 aa  145  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2835  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.54 
 
 
224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>