More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1595 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1595  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
214 aa  440  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000272068  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1734  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  95.79 
 
 
214 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000105531  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2550  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  95.79 
 
 
214 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000126905  hitchhiker  0.000000000223078 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1772  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  95.33 
 
 
214 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000685362  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1729  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  95.33 
 
 
214 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000874228  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2381  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  90.19 
 
 
214 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0156868  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2453  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  90.19 
 
 
214 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0349529  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2546  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  90.19 
 
 
214 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000131759  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2761  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  89.25 
 
 
214 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2578  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  82.71 
 
 
214 aa  371  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0668688  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1451  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  79.91 
 
 
214 aa  360  1e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00170053  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1512  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  80.37 
 
 
214 aa  358  4e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000374503  normal  0.459598 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2745  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  78.5 
 
 
214 aa  353  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000377179  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2095  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  78.1 
 
 
213 aa  344  5e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000370583  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1844  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  75.7 
 
 
214 aa  339  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000807934  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2098  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  77.14 
 
 
212 aa  339  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.545159  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  66.35 
 
 
213 aa  276  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002780  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.24 
 
 
220 aa  268  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2490  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.14 
 
 
218 aa  262  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135509  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.33 
 
 
212 aa  257  8e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2391  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.49 
 
 
214 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03201  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.32 
 
 
212 aa  250  9.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02392  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.33 
 
 
212 aa  248  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2783  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.33 
 
 
212 aa  248  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.154299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1176  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.33 
 
 
212 aa  248  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02354  hypothetical protein  59.33 
 
 
212 aa  248  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110228  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2635  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.33 
 
 
212 aa  248  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2874  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.33 
 
 
212 aa  248  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.551814  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1068  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.81 
 
 
220 aa  247  7e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1169  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.85 
 
 
212 aa  247  9e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.85 
 
 
212 aa  247  9e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.54 
 
 
217 aa  247  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2760  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.42 
 
 
212 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2696  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.42 
 
 
212 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3723  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.85 
 
 
212 aa  245  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.160201  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.42 
 
 
212 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.42 
 
 
212 aa  245  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02149  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.62 
 
 
216 aa  244  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0893  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.42 
 
 
219 aa  244  6.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000873186 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2869  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.94 
 
 
212 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.69 
 
 
214 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4054  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.93 
 
 
217 aa  236  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2993  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.07 
 
 
212 aa  234  8e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1664  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.46 
 
 
217 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278539  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.99 
 
 
217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1063  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.15 
 
 
212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1632  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.46 
 
 
216 aa  231  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0554809 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3525  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.29 
 
 
212 aa  227  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0302516  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2989  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.55 
 
 
213 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0264  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.4 
 
 
215 aa  225  4e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.33 
 
 
212 aa  225  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.33 
 
 
212 aa  225  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.58 
 
 
222 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.33 
 
 
212 aa  225  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1929  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.91 
 
 
215 aa  224  6e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.42 
 
 
222 aa  223  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3690  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.58 
 
 
216 aa  221  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.864702  decreased coverage  0.000250374 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.74 
 
 
217 aa  221  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923837  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3188  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.62 
 
 
211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1128  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.11 
 
 
212 aa  219  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2113  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.81 
 
 
249 aa  219  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0515  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55 
 
 
226 aa  219  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.549179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1699  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.17 
 
 
216 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26745  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.76 
 
 
220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36900  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.29 
 
 
215 aa  210  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.5 
 
 
214 aa  209  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.259794  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.65 
 
 
245 aa  208  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0576  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.08 
 
 
221 aa  207  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.116598 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2428  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.76 
 
 
220 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  hitchhiker  0.000000443644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2557  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.76 
 
 
220 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.01 
 
 
221 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5842  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.75 
 
 
220 aa  203  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1899  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.24 
 
 
220 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2510  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.24 
 
 
220 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2535  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.24 
 
 
220 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0808214 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.25 
 
 
210 aa  202  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.88 
 
 
223 aa  200  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.53 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0785  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.74 
 
 
220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160821 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.5 
 
 
215 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.5 
 
 
222 aa  198  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0073  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.31 
 
 
219 aa  199  3.9999999999999996e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.04 
 
 
216 aa  198  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.05 
 
 
217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0740  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.79 
 
 
209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.6 
 
 
220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.55 
 
 
209 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2666  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.76 
 
 
213 aa  193  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.48 
 
 
216 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.826865  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2333  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.44 
 
 
216 aa  191  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal  0.274367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1824  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.74 
 
 
218 aa  189  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00661254  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.95 
 
 
212 aa  187  8e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3927  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.63 
 
 
198 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.06 
 
 
220 aa  186  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1094  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.47 
 
 
223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.538676  hitchhiker  0.0026309 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.94 
 
 
224 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3843  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.32 
 
 
199 aa  181  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0791842  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1240  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.21 
 
 
223 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000502279 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1574  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.84 
 
 
229 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.81 
 
 
198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>