More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1295 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1295  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
204 aa  413  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.295392  normal  0.387449 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1872  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.67 
 
 
222 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0218  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.94 
 
 
206 aa  185  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1546  formyl transferase-like protein  48.88 
 
 
190 aa  180  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1020  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.76 
 
 
197 aa  176  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2279  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.5 
 
 
200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0431  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.46 
 
 
200 aa  170  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0504  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.67 
 
 
200 aa  170  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304229  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1978  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.41 
 
 
200 aa  169  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.45 
 
 
200 aa  167  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301418 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1701  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.1 
 
 
200 aa  167  8e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.489442  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.9 
 
 
313 aa  167  9e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.2 
 
 
218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.59 
 
 
203 aa  161  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1765  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.55 
 
 
204 aa  158  7e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.916451  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.88 
 
 
204 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.37 
 
 
204 aa  155  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1630  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.09 
 
 
214 aa  155  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.18 
 
 
211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1446  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.08 
 
 
218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.21 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.95 
 
 
216 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.826865  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37 
 
 
210 aa  149  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.57 
 
 
212 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.63 
 
 
216 aa  149  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.57 
 
 
212 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.57 
 
 
212 aa  149  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.25 
 
 
220 aa  149  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2989  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.11 
 
 
213 aa  148  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.97 
 
 
219 aa  148  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.54 
 
 
220 aa  148  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02149  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39 
 
 
216 aa  147  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.06 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.95 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2869  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.2 
 
 
212 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.62 
 
 
217 aa  145  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.54 
 
 
225 aa  145  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.364169  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1477  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40 
 
 
200 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2333  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.11 
 
 
216 aa  144  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal  0.274367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.6 
 
 
209 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6266  predicted protein  38.42 
 
 
206 aa  144  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00248936  normal  0.275546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.87 
 
 
219 aa  143  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.82 
 
 
212 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.71 
 
 
212 aa  142  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0676  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.75 
 
 
204 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0764  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.84 
 
 
203 aa  142  3e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2760  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.69 
 
 
212 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.69 
 
 
212 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2696  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.69 
 
 
212 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02392  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.71 
 
 
212 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.71 
 
 
209 aa  142  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.69 
 
 
212 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1176  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.71 
 
 
212 aa  142  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1617  Formyl transferase-like  44.39 
 
 
185 aa  142  4e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02354  hypothetical protein  35.71 
 
 
212 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2783  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.71 
 
 
212 aa  142  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.154299  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0674  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.75 
 
 
204 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.34 
 
 
216 aa  142  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992946 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2874  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.71 
 
 
212 aa  142  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.551814  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2635  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.71 
 
 
212 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1138  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.77 
 
 
210 aa  141  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3723  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.71 
 
 
212 aa  141  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.160201  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0726  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39 
 
 
196 aa  140  9e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000428099  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1169  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.2 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0726  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.49 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.303566  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1896  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.86 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01770  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.78 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1570  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.86 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000536598 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1572  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.86 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481989 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.49 
 
 
202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.05 
 
 
214 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.49 
 
 
194 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2993  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.11 
 
 
212 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.04 
 
 
222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0343  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.86 
 
 
195 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.6 
 
 
212 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.24 
 
 
205 aa  138  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.400719 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.86 
 
 
195 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.86 
 
 
223 aa  138  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0763  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, putative  38.27 
 
 
186 aa  138  6e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.211527  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0709  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.14 
 
 
205 aa  138  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3525  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.57 
 
 
212 aa  137  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0302516  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0326  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.86 
 
 
195 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.14 
 
 
205 aa  137  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4977  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.34 
 
 
195 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.57 
 
 
221 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0236  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.25 
 
 
212 aa  137  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.822796 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0898  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.53 
 
 
195 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.414511  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.36 
 
 
205 aa  137  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3468  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.87 
 
 
207 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.34 
 
 
195 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0269  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.34 
 
 
195 aa  136  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0297  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.34 
 
 
195 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0329  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.34 
 
 
195 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1063  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.91 
 
 
212 aa  136  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2182  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.01 
 
 
207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36 
 
 
220 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1824  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.08 
 
 
218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00661254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.08 
 
 
206 aa  135  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.02 
 
 
222 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>