More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1617 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1617  Formyl transferase-like  100 
 
 		 185 aa  368  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1295  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.39 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.295392  normal  0.387449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1020  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.17 
 
 		 197 aa  135  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1872  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.41 
 
 		 222 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0218  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.32 
 
 		 206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0504  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.02 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304229  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1978  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.17 
 
 		 200 aa  124  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0431  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.39 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1109  formyl transferase domain protein  41.53 
 
 		 181 aa  123  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0530  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.11 
 
 		 188 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4818  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.33 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.519157  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2482  formyl transferase domain protein  40.91 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.712391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1136  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.11 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0719  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.11 
 
 		 193 aa  121  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0522  formyl transferase domain-containing protein  37.36 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.220861  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1765  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.96 
 
 		 204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.916451  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1701  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.45 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.489442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2279  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.96 
 
 		 200 aa  118  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2111  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.23 
 
 		 189 aa  117  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0810  formyl transferase domain protein  38.64 
 
 		 192 aa  117  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1766  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.85 
 
 		 193 aa  114  6e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.64 
 
 		 313 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.71 
 
 		 200 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301418 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1546  formyl transferase-like protein  33.9 
 
 		 190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0143  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.86 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6266  predicted protein  33.55 
 
 		 206 aa  105  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00248936  normal  0.275546 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3468  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.85 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1138  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.84 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.78 
 
 		 195 aa  104  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0269  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.78 
 
 		 195 aa  104  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0297  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.78 
 
 		 195 aa  104  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0329  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.78 
 
 		 195 aa  104  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0272  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.78 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3310  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.43 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0326  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.22 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0343  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.78 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.2 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1032  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.64 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.22 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01770  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.98 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1637  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.41 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0035  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.15 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1644  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.87 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.7 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0276  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.22 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4977  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.22 
 
 		 195 aa  101  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0278  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.67 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1446  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.77 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0564  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.61 
 
 		 218 aa  99  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513649  normal  0.0898016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3378  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.05 
 
 		 205 aa  97.8  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.092004 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47067  predicted protein  33.69 
 
 		 1237 aa  95.9  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.375267  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2182  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.34 
 
 		 207 aa  95.5  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03155  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.57 
 
 		 130 aa  95.5  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1486  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.1 
 
 		 206 aa  94.7  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000112239  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1776  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.72 
 
 		 213 aa  95.1  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000344484  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0726  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.26 
 
 		 206 aa  94.7  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.303566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0674  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.22 
 
 		 204 aa  94.7  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09921  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.22 
 
 		 232 aa  94.4  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.337887 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0319  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.22 
 
 		 232 aa  94.4  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.0027967  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2645  formyl transferase domain protein  29.89 
 
 		 316 aa  92.8  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0676  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.69 
 
 		 204 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0457  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.79 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.75 
 
 		 216 aa  92  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.56 
 
 		 212 aa  91.3  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.56 
 
 		 212 aa  91.3  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4633  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.72 
 
 		 239 aa  91.3  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.56 
 
 		 212 aa  91.3  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1129  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.19 
 
 		 214 aa  90.9  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0958  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.37 
 
 		 209 aa  90.9  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.779009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 		 211 aa  90.9  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1102  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.19 
 
 		 214 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0524  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.15 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1896  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.71 
 
 		 277 aa  90.1  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1910  formyl transferase domain-containing protein  33.53 
 
 		 277 aa  89.7  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0109329  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1778  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.21 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.65 
 
 		 203 aa  89  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  28.95 
 
 		 225 aa  88.6  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.364169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1929  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.65 
 
 		 215 aa  88.2  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.02 
 
 		 217 aa  88.2  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0264  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.11 
 
 		 215 aa  87.8  8e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1281  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  26.92 
 
 		 195 aa  87.4  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1247  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.47 
 
 		 209 aa  87.8  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000481744  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  32.63 
 
 		 284 aa  87  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0763  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, putative  33.87 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.211527  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  27.42 
 
 		 230 aa  87  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0394188  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09701  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35 
 
 		 218 aa  87  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0103  formyl transferase domain-containing protein  34.19 
 
 		 279 aa  87  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0677899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04220  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, formyltetrahydrofolate-dependent  29.78 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  33.16 
 
 		 284 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0052  formyl transferase domain protein  35.96 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0388  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.09 
 
 		 185 aa  86.3  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3188  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.78 
 
 		 211 aa  86.3  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1407  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.26 
 
 		 202 aa  85.9  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0909  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 		 244 aa  85.9  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1259  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.05 
 
 		 212 aa  85.9  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.582521  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2333  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.26 
 
 		 216 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal  0.274367 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09681  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.96 
 
 		 218 aa  85.9  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0039  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  28.16 
 
 		 225 aa  85.5  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1132  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.731363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>