More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0564 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0564  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
218 aa  447  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513649  normal  0.0898016 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0039  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  74.37 
 
 
225 aa  313  9.999999999999999e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4633  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  66.34 
 
 
239 aa  296  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614886  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0478  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  67.16 
 
 
212 aa  292  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1102  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.5 
 
 
214 aa  281  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1129  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.5 
 
 
214 aa  280  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4900  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  68.54 
 
 
410 aa  249  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367196 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0958  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.86 
 
 
209 aa  239  2.9999999999999997e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.779009  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15111  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.64 
 
 
250 aa  228  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.165078 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08731  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.25 
 
 
213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.26 
 
 
230 aa  207  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0394188  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1388  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.5 
 
 
186 aa  205  5e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.78 
 
 
206 aa  203  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09921  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.74 
 
 
232 aa  201  8e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.337887 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0319  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.83 
 
 
232 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.0027967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.59 
 
 
204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.06 
 
 
206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.57 
 
 
204 aa  194  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.4 
 
 
218 aa  193  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.46 
 
 
206 aa  193  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192447  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.24 
 
 
206 aa  186  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000116567  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09681  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.93 
 
 
218 aa  185  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09731  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.03 
 
 
218 aa  181  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.372545  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2208  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.68 
 
 
224 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.128407  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.4 
 
 
202 aa  181  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09701  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43 
 
 
218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.79 
 
 
206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.68 
 
 
203 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0909  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43 
 
 
244 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1776  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.21 
 
 
213 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000344484  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04220  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, formyltetrahydrofolate-dependent  44.57 
 
 
212 aa  176  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.7 
 
 
211 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2448  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.39 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.325008  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.26 
 
 
216 aa  173  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992946 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0532  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.15 
 
 
202 aa  171  6.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00415647  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.88 
 
 
220 aa  171  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1281  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.99 
 
 
195 aa  170  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.78 
 
 
225 aa  170  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.364169  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0343  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44 
 
 
195 aa  170  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.38 
 
 
205 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.81 
 
 
212 aa  169  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4977  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44 
 
 
195 aa  169  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.43 
 
 
195 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0326  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.43 
 
 
195 aa  168  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.43 
 
 
195 aa  168  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0269  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.43 
 
 
195 aa  168  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0329  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.43 
 
 
195 aa  168  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0297  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.43 
 
 
195 aa  168  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.72 
 
 
214 aa  168  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0278  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44 
 
 
195 aa  168  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.02 
 
 
205 aa  167  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1630  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.81 
 
 
214 aa  167  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0272  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.86 
 
 
195 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01770  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.18 
 
 
201 aa  165  5.9999999999999996e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.47 
 
 
209 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2609  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.16 
 
 
225 aa  164  8e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5548  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.18 
 
 
220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0276  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.14 
 
 
195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2703  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.92 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00267955  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.22 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0726  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.93 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.303566  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1890  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.94 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.505321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.41 
 
 
219 aa  162  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.63 
 
 
225 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.86 
 
 
219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1872  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.46 
 
 
222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1407  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.5 
 
 
202 aa  161  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0643  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.62 
 
 
217 aa  161  8.000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104742  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02149  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.69 
 
 
216 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.86 
 
 
215 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0677  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.01 
 
 
225 aa  160  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.744174  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2666  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.63 
 
 
213 aa  160  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1417  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.11 
 
 
205 aa  160  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000602325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.3 
 
 
205 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.400719 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.31 
 
 
219 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0253  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.41 
 
 
229 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.15 
 
 
222 aa  159  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.02 
 
 
313 aa  159  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.55 
 
 
210 aa  158  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0035  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.83 
 
 
204 aa  158  7e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0515  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.21 
 
 
226 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.549179 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0913  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.46 
 
 
210 aa  156  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3391  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.68 
 
 
194 aa  155  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1976  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.04 
 
 
208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.44 
 
 
208 aa  155  6e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.147128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2835  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.56 
 
 
224 aa  154  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.11 
 
 
213 aa  154  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.44 
 
 
245 aa  154  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.04 
 
 
224 aa  154  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0143  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.51 
 
 
190 aa  154  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0740  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.33 
 
 
209 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2729  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.15 
 
 
194 aa  153  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5165  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.96 
 
 
218 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820799  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_002978  WD0763  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, putative  43.65 
 
 
186 aa  153  2e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.211527  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1812  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.89 
 
 
202 aa  153  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.68 
 
 
220 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.44 
 
 
217 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.05 
 
 
209 aa  153  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5372  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.11 
 
 
192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.421212 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.76 
 
 
223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>