More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1109 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1109  formyl transferase domain protein  100 
 
 
181 aa  357  4e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1032  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.54 
 
 
187 aa  161  4.0000000000000004e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1978  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.55 
 
 
200 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1701  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.49 
 
 
200 aa  148  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.489442  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2111  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.62 
 
 
189 aa  144  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1872  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.22 
 
 
222 aa  144  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0504  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.36 
 
 
200 aa  143  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304229  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1136  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.98 
 
 
189 aa  142  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.36 
 
 
200 aa  142  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301418 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1765  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.74 
 
 
204 aa  142  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.916451  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2279  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.43 
 
 
200 aa  141  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0431  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.43 
 
 
200 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0052  formyl transferase domain protein  42.08 
 
 
182 aa  137  7e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0524  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.93 
 
 
204 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0522  formyl transferase domain-containing protein  40.33 
 
 
187 aa  134  8e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.220861  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0530  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.53 
 
 
188 aa  134  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1446  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.46 
 
 
218 aa  134  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3310  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.25 
 
 
195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1259  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.11 
 
 
212 aa  129  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.582521  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0676  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.43 
 
 
204 aa  128  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1295  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.5 
 
 
204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.295392  normal  0.387449 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.7 
 
 
220 aa  127  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0674  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.89 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1020  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.57 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0719  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.1 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.33 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.84 
 
 
313 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3468  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.68 
 
 
207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1138  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.23 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1617  Formyl transferase-like  41.53 
 
 
185 aa  123  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0810  formyl transferase domain protein  41.99 
 
 
192 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.22 
 
 
205 aa  120  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4818  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.57 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.519157  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.96 
 
 
222 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.84 
 
 
213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.57 
 
 
194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.84 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992946 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.57 
 
 
245 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2482  formyl transferase domain protein  35.48 
 
 
189 aa  119  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.712391  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6266  predicted protein  35.26 
 
 
206 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00248936  normal  0.275546 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1417  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.23 
 
 
205 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000602325  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0643  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.15 
 
 
217 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104742  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.36 
 
 
216 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0218  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.63 
 
 
206 aa  117  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09731  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.83 
 
 
218 aa  117  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.372545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4977  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.7 
 
 
195 aa  117  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0964  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.57 
 
 
218 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597426 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.11 
 
 
221 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02149  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.43 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.51 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1169  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.17 
 
 
212 aa  115  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0576  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.75 
 
 
221 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.116598 
 
 
-
 
NC_002978  WD0763  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, putative  35.48 
 
 
186 aa  115  3e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.211527  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0474  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.33 
 
 
192 aa  115  3e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.462514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0343  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.7 
 
 
195 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.17 
 
 
195 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1407  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.76 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02392  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.65 
 
 
212 aa  114  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1176  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.65 
 
 
212 aa  114  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.17 
 
 
195 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0269  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.17 
 
 
195 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0329  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.17 
 
 
195 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0297  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.17 
 
 
195 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2783  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.65 
 
 
212 aa  114  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.154299  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02354  hypothetical protein  36.65 
 
 
212 aa  114  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110228  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.65 
 
 
212 aa  115  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0272  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.11 
 
 
195 aa  114  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2635  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.65 
 
 
212 aa  114  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.7 
 
 
227 aa  114  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3462  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.33 
 
 
217 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19888  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2874  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.13 
 
 
212 aa  114  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.551814  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2761  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.51 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0764  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.84 
 
 
203 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.65 
 
 
202 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1574  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.55 
 
 
229 aa  113  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3723  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.13 
 
 
212 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.160201  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0326  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.64 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0641  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.26 
 
 
208 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2993  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.76 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.58 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2182  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.75 
 
 
207 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03155  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.22 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0236  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.04 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.822796 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2835  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.77 
 
 
224 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0278  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.17 
 
 
195 aa  112  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1531  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.69 
 
 
197 aa  112  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.468098  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1247  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.75 
 
 
209 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000481744  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.21 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2989  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.42 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1063  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.2 
 
 
212 aa  111  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.66 
 
 
222 aa  111  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1240  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.32 
 
 
223 aa  111  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000502279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1094  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.84 
 
 
223 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.538676  hitchhiker  0.0026309 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0726  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.58 
 
 
206 aa  110  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.303566  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.62 
 
 
208 aa  111  7.000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.147128  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2869  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.13 
 
 
212 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.98 
 
 
214 aa  110  9e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.259794  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.21 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2760  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.13 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2546  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.37 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000131759  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>