More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1878 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
200 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301418 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1701  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  73.74 
 
 
200 aa  318  3.9999999999999996e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.489442  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0504  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.59 
 
 
200 aa  273  9e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304229  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0431  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.94 
 
 
200 aa  267  1e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2279  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.59 
 
 
200 aa  266  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1978  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.59 
 
 
200 aa  262  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1765  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  64.1 
 
 
204 aa  261  4.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.916451  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1872  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.89 
 
 
222 aa  219  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1446  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.39 
 
 
218 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1295  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.45 
 
 
204 aa  167  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.295392  normal  0.387449 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.21 
 
 
220 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0272  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.72 
 
 
195 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0343  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.24 
 
 
195 aa  166  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4977  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.24 
 
 
195 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.98 
 
 
222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.24 
 
 
195 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0326  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.24 
 
 
195 aa  165  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.72 
 
 
195 aa  165  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0269  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.72 
 
 
195 aa  165  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0329  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.72 
 
 
195 aa  165  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0297  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.72 
 
 
195 aa  165  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.36 
 
 
221 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0218  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.5 
 
 
206 aa  162  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0278  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.69 
 
 
195 aa  162  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.88 
 
 
245 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0530  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.02 
 
 
188 aa  159  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.63 
 
 
219 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.49 
 
 
219 aa  158  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.63 
 
 
219 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3853  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.3 
 
 
220 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0964  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.92 
 
 
218 aa  155  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1020  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.96 
 
 
197 aa  155  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1598  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.27 
 
 
217 aa  154  9e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.718303  normal  0.398382 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.49 
 
 
214 aa  154  9e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.259794  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5842  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.27 
 
 
220 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1138  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.21 
 
 
210 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.74 
 
 
217 aa  153  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0785  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.79 
 
 
220 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5548  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.97 
 
 
220 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0576  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.89 
 
 
221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.116598 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2111  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.86 
 
 
189 aa  152  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.74 
 
 
209 aa  152  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.59 
 
 
220 aa  152  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2535  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.22 
 
 
220 aa  151  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0808214 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.79 
 
 
214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3310  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.32 
 
 
195 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.71 
 
 
216 aa  150  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.53 
 
 
214 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.47 
 
 
216 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.88 
 
 
211 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2428  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.22 
 
 
220 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  hitchhiker  0.000000443644 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.36 
 
 
222 aa  150  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1899  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.22 
 
 
220 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2557  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.22 
 
 
220 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.72 
 
 
203 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2510  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.22 
 
 
220 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0740  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.95 
 
 
209 aa  148  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0276  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.7 
 
 
195 aa  148  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6266  predicted protein  41.49 
 
 
206 aa  147  7e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00248936  normal  0.275546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1094  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.12 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.538676  hitchhiker  0.0026309 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.63 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0726  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.58 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000428099  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3468  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.38 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3462  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.4 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19888  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1776  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.97 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000344484  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.42 
 
 
216 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.826865  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.17 
 
 
205 aa  145  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1240  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.62 
 
 
223 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000502279 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1574  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.75 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.27 
 
 
313 aa  145  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0676  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.89 
 
 
204 aa  145  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.89 
 
 
206 aa  145  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1896  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.58 
 
 
219 aa  144  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1570  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.58 
 
 
219 aa  144  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000536598 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1572  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.58 
 
 
219 aa  144  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0810  formyl transferase domain protein  39.06 
 
 
192 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02149  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.04 
 
 
216 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.89 
 
 
213 aa  143  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0033  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.67 
 
 
192 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519316  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04220  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, formyltetrahydrofolate-dependent  36.65 
 
 
212 aa  143  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2544  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.82 
 
 
193 aa  143  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.715033  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0490  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.84 
 
 
216 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.7 
 
 
194 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.43 
 
 
203 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0674  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.36 
 
 
204 aa  143  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0709  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.45 
 
 
205 aa  142  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.9 
 
 
218 aa  142  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2333  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.89 
 
 
216 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal  0.274367 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.45 
 
 
205 aa  142  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1531  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.21 
 
 
197 aa  142  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.468098  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1109  formyl transferase domain protein  39.36 
 
 
181 aa  142  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.89 
 
 
204 aa  141  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0719  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.63 
 
 
193 aa  141  5e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0126  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.06 
 
 
198 aa  141  6e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1275  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.29 
 
 
198 aa  141  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.42 
 
 
222 aa  141  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.27 
 
 
214 aa  141  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40 
 
 
206 aa  141  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.89 
 
 
222 aa  140  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5165  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.93 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820799  normal  0.144066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>