More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0218 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0218  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
206 aa  414  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1295  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.94 
 
 
204 aa  185  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.295392  normal  0.387449 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1546  formyl transferase-like protein  54.8 
 
 
190 aa  182  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1872  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.59 
 
 
222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0431  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.09 
 
 
200 aa  169  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1765  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.21 
 
 
204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.916451  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1020  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.28 
 
 
197 aa  164  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1701  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.74 
 
 
200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.489442  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.5 
 
 
200 aa  162  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301418 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1978  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.21 
 
 
200 aa  161  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0504  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.86 
 
 
200 aa  159  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304229  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2279  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.15 
 
 
200 aa  154  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.38 
 
 
214 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04220  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, formyltetrahydrofolate-dependent  37.69 
 
 
212 aa  137  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1446  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.37 
 
 
218 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.41 
 
 
313 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.56 
 
 
222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1617  Formyl transferase-like  36.32 
 
 
185 aa  128  7.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6266  predicted protein  42.31 
 
 
206 aa  127  8.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00248936  normal  0.275546 
 
 
-
 
NC_002950  PG1766  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.78 
 
 
193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1657  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.17 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3310  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.9 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0236  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.11 
 
 
212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.822796 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3437  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.33 
 
 
192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.333291 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2835  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.49 
 
 
224 aa  125  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4633  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.1 
 
 
239 aa  125  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614886  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.88 
 
 
216 aa  125  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992946 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0674  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.66 
 
 
204 aa  124  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2533  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.41 
 
 
218 aa  124  9e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272772  normal  0.391268 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1281  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.82 
 
 
195 aa  124  9e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0719  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.79 
 
 
193 aa  124  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0143  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.36 
 
 
190 aa  124  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.25 
 
 
220 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.34 
 
 
211 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0740  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.88 
 
 
209 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.36 
 
 
225 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.364169  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.72 
 
 
214 aa  123  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0676  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.11 
 
 
204 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.34 
 
 
245 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2482  formyl transferase domain protein  34.74 
 
 
189 aa  123  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.712391  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0033  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.99 
 
 
192 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519316  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.85 
 
 
217 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.18 
 
 
220 aa  122  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0677  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.04 
 
 
225 aa  122  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.744174  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.31 
 
 
209 aa  121  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4818  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.79 
 
 
193 aa  121  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.519157  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02149  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.38 
 
 
216 aa  121  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0726  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.79 
 
 
206 aa  121  9e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.303566  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.84 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.22 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0764  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.38 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.38 
 
 
212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2544  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.67 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.715033  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1138  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.7 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0958  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.09 
 
 
209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.779009  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.81 
 
 
222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.38 
 
 
212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.38 
 
 
212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.9 
 
 
203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3927  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.3 
 
 
198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0678  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.78 
 
 
196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1649  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.79 
 
 
197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318783  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0530  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.16 
 
 
188 aa  118  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0785  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.86 
 
 
220 aa  118  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160821 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1417  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.57 
 
 
205 aa  118  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000602325  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1109  formyl transferase domain protein  32.63 
 
 
181 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.87 
 
 
216 aa  117  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1758  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.21 
 
 
315 aa  117  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3468  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.96 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0319  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.79 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.0027967  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.53 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3843  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.17 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0791842  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09921  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.79 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.337887 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.04 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1976  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.04 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5842  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.85 
 
 
220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.52 
 
 
224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2111  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.21 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0515  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.94 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.549179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0478  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.71 
 
 
212 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.24 
 
 
203 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1899  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.85 
 
 
220 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2510  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.85 
 
 
220 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1574  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.71 
 
 
229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.46 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0126  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.86 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0964  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.18 
 
 
218 aa  115  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.86 
 
 
216 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.826865  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.85 
 
 
215 aa  115  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2666  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.69 
 
 
213 aa  115  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1970  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.79 
 
 
182 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.46 
 
 
219 aa  115  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1477  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.16 
 
 
200 aa  115  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1275  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.18 
 
 
198 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0272  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.79 
 
 
195 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2535  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.34 
 
 
220 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0808214 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.67 
 
 
218 aa  115  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1888  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.5 
 
 
197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00391405  normal  0.23878 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1388  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.57 
 
 
186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1630  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.2 
 
 
214 aa  114  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>