More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03155 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03155  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
130 aa  263  8e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0719  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.17 
 
 
193 aa  154  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1136  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.17 
 
 
189 aa  150  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4818  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.83 
 
 
193 aa  146  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.519157  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0530  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.3 
 
 
188 aa  144  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2482  formyl transferase domain protein  57.26 
 
 
189 aa  142  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.712391  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3310  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.14 
 
 
195 aa  136  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0810  formyl transferase domain protein  47.5 
 
 
192 aa  131  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1766  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.33 
 
 
193 aa  129  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2279  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.16 
 
 
200 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0504  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.83 
 
 
200 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304229  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1978  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.33 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.83 
 
 
200 aa  117  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301418 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1701  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.83 
 
 
200 aa  115  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.489442  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1109  formyl transferase domain protein  46.22 
 
 
181 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1765  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.5 
 
 
204 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.916451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1295  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.59 
 
 
204 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.295392  normal  0.387449 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1446  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.75 
 
 
218 aa  107  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0052  formyl transferase domain protein  42.5 
 
 
182 aa  105  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0431  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.71 
 
 
200 aa  104  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0522  formyl transferase domain-containing protein  43.22 
 
 
187 aa  104  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.220861  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3468  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.67 
 
 
207 aa  103  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1032  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.04 
 
 
187 aa  103  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6266  predicted protein  44.54 
 
 
206 aa  102  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00248936  normal  0.275546 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1872  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.32 
 
 
222 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0676  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.44 
 
 
204 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0674  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.62 
 
 
204 aa  99.8  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.69 
 
 
214 aa  98.6  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2111  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.08 
 
 
189 aa  98.2  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0524  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.61 
 
 
204 aa  97.4  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1546  formyl transferase-like protein  36.36 
 
 
190 aa  97.4  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1617  Formyl transferase-like  48.57 
 
 
185 aa  95.5  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1020  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.97 
 
 
197 aa  94.4  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0218  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.04 
 
 
206 aa  94  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.54 
 
 
313 aa  93.6  8e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0764  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35 
 
 
203 aa  88.6  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1259  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.48 
 
 
212 aa  87.8  4e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.582521  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3378  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.65 
 
 
205 aa  87.8  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.092004 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0388  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.5 
 
 
185 aa  87.4  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1138  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.67 
 
 
210 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0657  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35 
 
 
188 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0726  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.05 
 
 
206 aa  85.5  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.303566  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2182  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.52 
 
 
207 aa  85.5  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1674  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.32 
 
 
203 aa  85.9  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.867032  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.89 
 
 
220 aa  85.5  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1572  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.34 
 
 
205 aa  84.7  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1844  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.11 
 
 
214 aa  84.7  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000807934  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0143  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.6 
 
 
190 aa  84.7  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1523  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.34 
 
 
202 aa  84.7  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2745  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.04 
 
 
214 aa  84.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000377179  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1778  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.33 
 
 
192 aa  84.3  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0821  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.53 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0770966  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1673  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.39 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0568966 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2761  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.34 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01770  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.25 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1130  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.36 
 
 
195 aa  82  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861334  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0126  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.75 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1247  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.67 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000481744  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2578  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.76 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0668688  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.51 
 
 
217 aa  81.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1574  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.63 
 
 
229 aa  80.9  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1063  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.93 
 
 
212 aa  80.5  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1595  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.9 
 
 
214 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000272068  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.17 
 
 
195 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0269  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.17 
 
 
195 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0329  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.17 
 
 
195 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0297  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.17 
 
 
195 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1888  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.67 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00391405  normal  0.23878 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0272  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.17 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.46 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0791  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.97 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277928  normal  0.560587 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1068  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.65 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2381  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.62 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0156868  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2453  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.62 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0349529  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1451  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.75 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00170053  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2546  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.62 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000131759  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.15 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.34 
 
 
213 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.06 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1729  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.9 
 
 
214 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000874228  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0678  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.03 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0643  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.48 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104742  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1734  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.9 
 
 
214 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000105531  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.45 
 
 
205 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.400719 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1772  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.9 
 
 
214 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000685362  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0726  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.25 
 
 
196 aa  79  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000428099  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2550  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.9 
 
 
214 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000126905  hitchhiker  0.000000000223078 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.5 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1637  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.61 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1531  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.52 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.468098  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1132  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.5 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.731363  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.13 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0276  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.5 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4977  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.17 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0343  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.17 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1644  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.61 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1857  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.82 
 
 
230 aa  78.2  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.147651 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1929  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.19 
 
 
215 aa  77.8  0.00000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.03 
 
 
212 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>