More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1857 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1857  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.147651 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1625  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  81.33 
 
 
240 aa  366  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1441  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  68.86 
 
 
232 aa  312  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1699  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.52 
 
 
216 aa  191  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26745  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.98 
 
 
214 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.45 
 
 
222 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.94 
 
 
217 aa  186  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02149  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.2 
 
 
216 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3690  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.04 
 
 
216 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.864702  decreased coverage  0.000250374 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0264  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.03 
 
 
215 aa  185  5e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1929  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.53 
 
 
215 aa  184  7e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.32 
 
 
217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.95 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.31 
 
 
217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923837  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.67 
 
 
213 aa  181  8.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2098  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.91 
 
 
212 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.545159  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0893  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.06 
 
 
219 aa  180  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000873186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1664  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.83 
 
 
217 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278539  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.21 
 
 
224 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.86 
 
 
245 aa  178  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.23 
 
 
220 aa  176  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4054  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.33 
 
 
217 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1632  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.95 
 
 
216 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0554809 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.78 
 
 
223 aa  174  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1068  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.32 
 
 
220 aa  174  9e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2490  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.78 
 
 
218 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135509  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0515  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.13 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.549179 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.62 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36900  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.92 
 
 
215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.46 
 
 
220 aa  171  6.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2550  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.94 
 
 
214 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000126905  hitchhiker  0.000000000223078 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1734  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.94 
 
 
214 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000105531  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1729  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.94 
 
 
214 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000874228  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1772  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.94 
 
 
214 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000685362  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.5 
 
 
210 aa  169  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2745  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.37 
 
 
214 aa  168  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000377179  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2381  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.43 
 
 
214 aa  167  9e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0156868  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2453  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.43 
 
 
214 aa  167  9e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0349529  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2546  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.43 
 
 
214 aa  167  9e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000131759  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1595  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.43 
 
 
214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000272068  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.13 
 
 
215 aa  165  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.39 
 
 
219 aa  164  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2391  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.08 
 
 
214 aa  164  9e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2993  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.86 
 
 
212 aa  164  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2113  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.13 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2578  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.3 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0668688  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0965  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.156307 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2761  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.15 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1844  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.44 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000807934  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1512  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.88 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000374503  normal  0.459598 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1451  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.54 
 
 
214 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00170053  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.74 
 
 
220 aa  163  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002780  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.2 
 
 
220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.45 
 
 
214 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.259794  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.38 
 
 
222 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1128  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.36 
 
 
212 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.49 
 
 
221 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2760  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.51 
 
 
212 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2095  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.36 
 
 
213 aa  158  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000370583  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1063  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.91 
 
 
212 aa  158  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.16 
 
 
219 aa  157  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40 
 
 
212 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40 
 
 
212 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.16 
 
 
219 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03201  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.75 
 
 
212 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40 
 
 
212 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2696  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.02 
 
 
212 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.02 
 
 
212 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.02 
 
 
212 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2869  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.02 
 
 
212 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.15 
 
 
313 aa  155  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.72 
 
 
222 aa  155  4e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.895502  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1651  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.55 
 
 
222 aa  155  6e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.662731  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02392  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.02 
 
 
212 aa  155  7e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1176  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.02 
 
 
212 aa  155  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3188  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.89 
 
 
211 aa  155  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02354  hypothetical protein  39.02 
 
 
212 aa  155  7e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2783  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.02 
 
 
212 aa  155  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.154299  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.02 
 
 
212 aa  154  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2874  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.02 
 
 
212 aa  154  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.551814  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2635  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.02 
 
 
212 aa  154  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.5 
 
 
206 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1169  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.54 
 
 
212 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.18 
 
 
212 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3525  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.65 
 
 
212 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0302516  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1259  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.5 
 
 
212 aa  152  4e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.582521  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3723  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.54 
 
 
212 aa  152  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.160201  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.69 
 
 
216 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2989  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.54 
 
 
213 aa  151  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2729  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.25 
 
 
194 aa  151  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3391  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.71 
 
 
194 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.11 
 
 
209 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2666  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.89 
 
 
213 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.38 
 
 
217 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.3 
 
 
206 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.69 
 
 
204 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1574  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41 
 
 
229 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.62 
 
 
205 aa  148  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0709  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.62 
 
 
205 aa  148  7e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.69 
 
 
204 aa  147  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>