More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1441 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1441  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
232 aa  470  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1857  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  68.86 
 
 
230 aa  312  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.147651 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1625  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  67.39 
 
 
240 aa  310  1e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.79 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.97 
 
 
222 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.39 
 
 
222 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02149  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.74 
 
 
216 aa  176  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1632  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.83 
 
 
216 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0554809 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0893  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.88 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000873186 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2098  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.5 
 
 
212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.545159  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.02 
 
 
217 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4054  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.28 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36900  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.69 
 
 
215 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.89 
 
 
217 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923837  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0515  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.48 
 
 
226 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.549179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1664  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.54 
 
 
217 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278539  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3690  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.41 
 
 
216 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.864702  decreased coverage  0.000250374 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.31 
 
 
217 aa  168  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2381  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.72 
 
 
214 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0156868  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2453  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.72 
 
 
214 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0349529  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2546  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.72 
 
 
214 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000131759  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1699  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.37 
 
 
216 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26745  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1512  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.92 
 
 
214 aa  166  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000374503  normal  0.459598 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0264  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.55 
 
 
215 aa  165  5e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1844  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.99 
 
 
214 aa  165  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000807934  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1929  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.06 
 
 
215 aa  165  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1734  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.72 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000105531  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1772  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.81 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000685362  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1729  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.81 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000874228  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2490  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.88 
 
 
218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135509  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2550  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.72 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000126905  hitchhiker  0.000000000223078 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2095  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.72 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000370583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.22 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1068  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.66 
 
 
220 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2578  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.81 
 
 
214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0668688  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2745  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.23 
 
 
214 aa  162  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000377179  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.41 
 
 
213 aa  161  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2761  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.43 
 
 
214 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.37 
 
 
210 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2993  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.15 
 
 
212 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1595  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.28 
 
 
214 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000272068  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1451  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.66 
 
 
214 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00170053  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.44 
 
 
220 aa  159  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.59 
 
 
222 aa  159  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2113  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.5 
 
 
249 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.78 
 
 
223 aa  157  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1063  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.21 
 
 
212 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.65 
 
 
224 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.57 
 
 
220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1888  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.81 
 
 
197 aa  155  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00391405  normal  0.23878 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2760  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.5 
 
 
212 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.92 
 
 
212 aa  154  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1169  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.42 
 
 
212 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2869  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.5 
 
 
212 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.92 
 
 
215 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.5 
 
 
212 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2696  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.5 
 
 
212 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.5 
 
 
212 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02392  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.92 
 
 
212 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2635  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.92 
 
 
212 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.41 
 
 
212 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02354  hypothetical protein  41.92 
 
 
212 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110228  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.41 
 
 
212 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2874  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.92 
 
 
212 aa  153  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.551814  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2783  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.92 
 
 
212 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.154299  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.41 
 
 
212 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1176  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.92 
 
 
212 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.1 
 
 
245 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1128  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.41 
 
 
212 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3723  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.41 
 
 
212 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.160201  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3188  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.91 
 
 
211 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.52 
 
 
219 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002780  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.76 
 
 
220 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0913  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.21 
 
 
210 aa  149  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.94 
 
 
212 aa  148  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.52 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.895502  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2391  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.46 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.6 
 
 
313 aa  146  3e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2989  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.89 
 
 
213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.63 
 
 
219 aa  145  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.82 
 
 
205 aa  145  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.63 
 
 
219 aa  145  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0709  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.82 
 
 
205 aa  145  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03201  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.25 
 
 
212 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1651  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.18 
 
 
222 aa  144  9e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.662731  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0965  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.29 
 
 
219 aa  143  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.156307 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0033  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.24 
 
 
192 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519316  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3525  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.92 
 
 
212 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0302516  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3927  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.35 
 
 
198 aa  142  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1259  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.7 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.582521  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.38 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.259794  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2666  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.89 
 
 
213 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.34 
 
 
216 aa  139  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1758  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.25 
 
 
315 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.2 
 
 
206 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1094  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.18 
 
 
223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.538676  hitchhiker  0.0026309 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1574  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.49 
 
 
229 aa  138  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.87 
 
 
221 aa  138  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0785  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.36 
 
 
220 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160821 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2557  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.36 
 
 
220 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>