More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1896 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1896  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
277 aa  543  1e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2193  formyl transferase domain-containing protein  77.26 
 
 
274 aa  421  1e-117  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0103  formyl transferase domain-containing protein  67.03 
 
 
279 aa  366  1e-100  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0677899  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1910  formyl transferase domain-containing protein  68.13 
 
 
277 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0109329  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1446  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.21 
 
 
218 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1872  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.32 
 
 
214 aa  119  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1407  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.59 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1295  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.3 
 
 
204 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.295392  normal  0.387449 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0599  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.56 
 
 
526 aa  116  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0676  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.76 
 
 
204 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0674  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.76 
 
 
204 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.17 
 
 
206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.68 
 
 
220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.12 
 
 
218 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1637  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.54 
 
 
192 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.78 
 
 
227 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877023 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.63 
 
 
210 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1259  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.17 
 
 
212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.582521  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.92 
 
 
313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1644  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.54 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 
202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1247  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.45 
 
 
209 aa  109  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000481744  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0763  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, putative  33.17 
 
 
186 aa  109  6e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.211527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.27 
 
 
203 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.91 
 
 
204 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1630  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.1 
 
 
214 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.15 
 
 
206 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000116567  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.67 
 
 
230 aa  106  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0394188  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2182  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.13 
 
 
207 aa  106  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1776  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.17 
 
 
213 aa  105  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000344484  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.43 
 
 
204 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1477  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.29 
 
 
200 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0898  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.56 
 
 
195 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.414511  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.73 
 
 
208 aa  105  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.147128  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.31 
 
 
209 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0524  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.12 
 
 
204 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.68 
 
 
221 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.15 
 
 
205 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1978  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.66 
 
 
200 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.07 
 
 
223 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1102  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.84 
 
 
214 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1129  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.34 
 
 
214 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3468  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.07 
 
 
207 aa  102  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.48 
 
 
216 aa  102  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992946 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0478  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.38 
 
 
212 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0039  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.34 
 
 
225 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2609  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.31 
 
 
225 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2703  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.75 
 
 
225 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00267955  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1824  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.25 
 
 
218 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00661254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.63 
 
 
206 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192447  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.84 
 
 
205 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.400719 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.19 
 
 
225 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1976  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 
208 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1657  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.66 
 
 
221 aa  100  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.96 
 
 
225 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.364169  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1701  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.98 
 
 
200 aa  99.8  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.489442  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3853  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.96 
 
 
220 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.55 
 
 
222 aa  99.8  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.48 
 
 
211 aa  99.4  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.17 
 
 
212 aa  99.4  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2208  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.68 
 
 
224 aa  99  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.128407  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0564  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.85 
 
 
218 aa  99  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513649  normal  0.0898016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.68 
 
 
206 aa  99  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.84 
 
 
205 aa  98.6  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0236  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.822796 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0643  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.16 
 
 
217 aa  98.2  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104742  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3155  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.1 
 
 
536 aa  98.2  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.262908  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1967  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.96 
 
 
236 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2448  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.67 
 
 
222 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.325008  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0641  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.67 
 
 
208 aa  97.8  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1275  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.53 
 
 
198 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0474  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.67 
 
 
192 aa  97.8  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.462514  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2769  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.88 
 
 
227 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4633  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.92 
 
 
239 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614886  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0033  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.46 
 
 
192 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519316  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2666  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.59 
 
 
213 aa  96.7  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0958  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 
209 aa  97.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.779009  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2488  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.18 
 
 
218 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.062829  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1574  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.6 
 
 
229 aa  97.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1281  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.8 
 
 
195 aa  96.3  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2835  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.42 
 
 
224 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2513  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.08 
 
 
230 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.23 
 
 
222 aa  96.3  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0218  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.71 
 
 
206 aa  95.9  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0457  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.74 
 
 
207 aa  95.5  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0504  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.99 
 
 
200 aa  95.5  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304229  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.98 
 
 
217 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.18 
 
 
224 aa  95.1  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2111  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.46 
 
 
189 aa  94.7  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1758  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.36 
 
 
315 aa  95.1  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2538  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.56 
 
 
206 aa  95.1  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0253  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0925  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.18 
 
 
535 aa  94  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000561233 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.86 
 
 
216 aa  94  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.9 
 
 
200 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301418 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1109  formyl transferase domain protein  31.31 
 
 
181 aa  93.6  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0431  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.17 
 
 
200 aa  93.6  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 
206 aa  93.6  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0321  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.12 
 
 
212 aa  93.2  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0640594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>