More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0321 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0321  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
212 aa  410  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0640594  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0457  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.29 
 
 
207 aa  149  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.99 
 
 
218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04960  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.72 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08731  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.57 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0326  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.27 
 
 
195 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4216  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.4 
 
 
217 aa  138  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.298326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.74 
 
 
195 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0269  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.74 
 
 
195 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0297  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.74 
 
 
195 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1366  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.11 
 
 
211 aa  136  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0329  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.74 
 
 
195 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1130  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.6 
 
 
195 aa  137  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861334  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.64 
 
 
205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0656  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.08 
 
 
216 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.9 
 
 
216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.04 
 
 
194 aa  135  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0272  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.74 
 
 
195 aa  135  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0343  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.22 
 
 
195 aa  135  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.74 
 
 
195 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.78 
 
 
203 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0278  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.22 
 
 
195 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.25 
 
 
211 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4320  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.37 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4977  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.22 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.37 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4406  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.37 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.24 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.71 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.364169  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0737  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.7 
 
 
213 aa  132  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.407866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.25 
 
 
204 aa  132  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2208  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.04 
 
 
224 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.128407  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.18 
 
 
204 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28120  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.56 
 
 
228 aa  131  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1138  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.24 
 
 
210 aa  131  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2533  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.08 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272772  normal  0.391268 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0677  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.01 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.744174  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.5 
 
 
214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.25 
 
 
206 aa  129  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192447  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3996  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.34 
 
 
198 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00211251  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.5 
 
 
206 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10974  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.3 
 
 
215 aa  129  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0809236  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0659  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.08 
 
 
219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.48364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0999  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.18 
 
 
194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.797413  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.83 
 
 
206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000116567  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1630  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.7 
 
 
214 aa  128  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3305  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.12 
 
 
204 aa  128  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.11 
 
 
220 aa  128  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3584  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.9 
 
 
208 aa  128  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0417204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3853  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.89 
 
 
220 aa  128  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.98 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07800  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, formyltetrahydrofolate-dependent  44.27 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.463663  normal  0.355884 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1812  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.27 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.57 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1102  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.17 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6504  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.11 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.3 
 
 
202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2666  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.08 
 
 
213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.46 
 
 
212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.67 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.400719 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.51 
 
 
212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0478  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.25 
 
 
212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.5 
 
 
210 aa  125  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.04 
 
 
230 aa  126  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0394188  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5974  phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase  43.39 
 
 
828 aa  126  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0783963  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 
214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.259794  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1129  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.1 
 
 
214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7981  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.43 
 
 
253 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.05 
 
 
220 aa  125  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.11 
 
 
206 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3843  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40 
 
 
199 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0791842  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0726  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.7 
 
 
206 aa  125  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.303566  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.71 
 
 
215 aa  124  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.27 
 
 
217 aa  124  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0657  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.98 
 
 
188 aa  124  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.56 
 
 
221 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.71 
 
 
216 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992946 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1281  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.08 
 
 
195 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.07 
 
 
216 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0709  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.75 
 
 
205 aa  123  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.75 
 
 
205 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0276  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 
195 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.62 
 
 
220 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.38 
 
 
188 aa  123  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1132  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.38 
 
 
188 aa  123  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.731363  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01770  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.5 
 
 
201 aa  122  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0676  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 
204 aa  122  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0674  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.83 
 
 
204 aa  122  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1657  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.15 
 
 
221 aa  122  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1673  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.64 
 
 
198 aa  122  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0568966 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0383  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.33 
 
 
202 aa  122  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.31 
 
 
219 aa  122  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.15 
 
 
216 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.826865  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.31 
 
 
219 aa  122  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0053  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.52 
 
 
184 aa  121  6e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.243956  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0253  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.81 
 
 
229 aa  121  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0236  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.96 
 
 
212 aa  121  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.822796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4857  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.03 
 
 
218 aa  121  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178721  normal  0.189612 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1874  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.88 
 
 
218 aa  121  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0142355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>