More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0383 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0383  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
202 aa  397  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4216  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  69.54 
 
 
217 aa  274  7e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.298326  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3584  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  69.07 
 
 
208 aa  272  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0417204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7981  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  66.18 
 
 
253 aa  267  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0659  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  68.02 
 
 
219 aa  265  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.48364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04960  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  64.62 
 
 
205 aa  249  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1247  putative phosphoribosylglycinamide formyltransferase  66.84 
 
 
206 aa  245  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.378039  normal  0.01712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4198  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  64.65 
 
 
206 aa  244  6e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0718234  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6504  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  68.69 
 
 
211 aa  244  6.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3807  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.64 
 
 
206 aa  244  9e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0610  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.2 
 
 
213 aa  234  9e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3965  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.97 
 
 
215 aa  232  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2533  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.91 
 
 
218 aa  223  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272772  normal  0.391268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.91 
 
 
209 aa  218  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4320  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.91 
 
 
209 aa  218  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802678  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4406  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.91 
 
 
209 aa  218  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1088  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.38 
 
 
187 aa  216  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28120  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.36 
 
 
228 aa  213  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0737  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.2 
 
 
213 aa  211  7.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.407866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1164  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.22 
 
 
188 aa  209  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000485336 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2573  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.76 
 
 
195 aa  207  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3996  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.33 
 
 
198 aa  204  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00211251  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1874  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.85 
 
 
218 aa  204  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0142355 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10974  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.41 
 
 
215 aa  204  9e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0809236  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3013  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.49 
 
 
211 aa  204  9e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000892633  hitchhiker  0.00295616 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24110  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.9 
 
 
202 aa  202  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4857  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.44 
 
 
218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178721  normal  0.189612 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4420  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  64.32 
 
 
205 aa  199  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1366  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.23 
 
 
211 aa  198  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0677  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.78 
 
 
225 aa  197  7e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.744174  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3305  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.88 
 
 
204 aa  197  9e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07800  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, formyltetrahydrofolate-dependent  55.78 
 
 
209 aa  195  5.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.463663  normal  0.355884 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1271  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.7 
 
 
208 aa  194  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246325  normal  0.912887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0656  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.67 
 
 
216 aa  191  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5974  phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase  54.1 
 
 
828 aa  190  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0783963  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1417  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.24 
 
 
205 aa  188  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000602325  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46 
 
 
205 aa  188  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.26 
 
 
211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04480  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.7 
 
 
187 aa  178  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47 
 
 
218 aa  177  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.45 
 
 
206 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.27 
 
 
203 aa  174  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1976  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.23 
 
 
208 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.85 
 
 
206 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0709  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.5 
 
 
205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.5 
 
 
205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3760  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.75 
 
 
205 aa  171  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234419  normal  0.638022 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.41 
 
 
206 aa  171  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.42 
 
 
206 aa  168  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.56 
 
 
204 aa  166  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.07 
 
 
204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2703  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.09 
 
 
225 aa  164  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00267955  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1890  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.62 
 
 
213 aa  164  9e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.505321 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1776  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.21 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000344484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2609  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.32 
 
 
225 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1477  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.08 
 
 
200 aa  161  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.83 
 
 
225 aa  160  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.8 
 
 
205 aa  160  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1812  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.41 
 
 
202 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0532  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.37 
 
 
202 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00415647  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.88 
 
 
205 aa  159  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.400719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.5 
 
 
206 aa  159  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1630  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.21 
 
 
214 aa  158  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3176  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.59 
 
 
215 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3378  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.04 
 
 
205 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.092004 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5548  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.72 
 
 
220 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2693  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.38 
 
 
217 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.467272  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2835  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.13 
 
 
224 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2577  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.37 
 
 
205 aa  156  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.829885  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0073  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.2 
 
 
219 aa  156  2e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04220  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, formyltetrahydrofolate-dependent  43.46 
 
 
212 aa  156  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.43 
 
 
206 aa  156  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000116567  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.41 
 
 
212 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.61 
 
 
215 aa  155  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.41 
 
 
212 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.41 
 
 
212 aa  155  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.81 
 
 
212 aa  155  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1063  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.21 
 
 
212 aa  155  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.71 
 
 
209 aa  154  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2208  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.12 
 
 
224 aa  154  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.128407  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1094  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.12 
 
 
223 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.538676  hitchhiker  0.0026309 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.19 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.82 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.71 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0999  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.28 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.797413  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2535  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.49 
 
 
220 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0808214 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.97 
 
 
221 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5842  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.49 
 
 
220 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2993  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.62 
 
 
212 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0035  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.65 
 
 
204 aa  150  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.04 
 
 
222 aa  149  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.12 
 
 
217 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1899  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.49 
 
 
220 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0576  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.62 
 
 
221 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.116598 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2510  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.49 
 
 
220 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.97 
 
 
220 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.13 
 
 
225 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.364169  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1486  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.18 
 
 
206 aa  149  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000112239  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2989  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.86 
 
 
213 aa  148  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0643  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.59 
 
 
217 aa  149  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>