More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0945 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
206 aa  417  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3176  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.17 
 
 
215 aa  221  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3378  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.71 
 
 
205 aa  218  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.092004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2693  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.97 
 
 
217 aa  214  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.467272  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1088  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.27 
 
 
187 aa  180  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1164  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.28 
 
 
188 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000485336 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4216  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.27 
 
 
217 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.298326  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0737  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.77 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.407866  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2533  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.29 
 
 
218 aa  153  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272772  normal  0.391268 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0383  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.5 
 
 
202 aa  152  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7981  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.35 
 
 
253 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04960  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.08 
 
 
205 aa  151  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0659  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.59 
 
 
219 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.48364 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28120  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.29 
 
 
228 aa  148  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3996  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.86 
 
 
198 aa  148  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00211251  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3584  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.3 
 
 
208 aa  147  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0417204  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0677  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.31 
 
 
225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.744174  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6504  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.28 
 
 
211 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0276  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.71 
 
 
195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4977  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.61 
 
 
195 aa  144  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0343  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.71 
 
 
195 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1247  putative phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.29 
 
 
206 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.378039  normal  0.01712 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0278  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.2 
 
 
195 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3965  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.3 
 
 
215 aa  143  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0326  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.41 
 
 
195 aa  141  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.41 
 
 
195 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.41 
 
 
195 aa  141  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0269  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.41 
 
 
195 aa  141  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0297  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.41 
 
 
195 aa  141  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0329  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.41 
 
 
195 aa  141  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.8 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0272  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.92 
 
 
195 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1477  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.7 
 
 
200 aa  138  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07800  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, formyltetrahydrofolate-dependent  39.41 
 
 
209 aa  138  6e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.463663  normal  0.355884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1874  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.82 
 
 
218 aa  137  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0142355 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10974  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.63 
 
 
215 aa  136  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0809236  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0999  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.21 
 
 
194 aa  136  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.797413  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04480  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.08 
 
 
187 aa  135  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1407  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.41 
 
 
202 aa  135  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4633  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.53 
 
 
239 aa  135  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614886  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0763  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, putative  36.27 
 
 
186 aa  134  7.000000000000001e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.211527  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08731  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.2 
 
 
213 aa  134  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.31 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2573  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.33 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0564  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.07 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513649  normal  0.0898016 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.96 
 
 
313 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4320  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.3 
 
 
209 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802678  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1890  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.13 
 
 
213 aa  132  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.505321 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4406  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.3 
 
 
209 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.3 
 
 
209 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.98 
 
 
205 aa  131  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0039  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.12 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.62 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.62 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0656  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.69 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5974  phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase  38.19 
 
 
828 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0783963  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1976  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.02 
 
 
208 aa  129  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0532  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.44 
 
 
202 aa  129  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00415647  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1417  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.2 
 
 
205 aa  129  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000602325  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.7 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4198  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.82 
 
 
206 aa  128  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0718234  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.93 
 
 
225 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.364169  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0643  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0610  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.81 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0126  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.43 
 
 
198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2609  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.07 
 
 
225 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3807  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.82 
 
 
206 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.02 
 
 
225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02149  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.05 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2989  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.54 
 
 
213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2208  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.07 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.128407  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0457  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.68 
 
 
207 aa  125  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.99 
 
 
215 aa  125  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4857  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.79 
 
 
218 aa  125  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178721  normal  0.189612 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.42 
 
 
206 aa  124  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.22 
 
 
222 aa  124  9e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1063  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.18 
 
 
212 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.86 
 
 
212 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2703  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.07 
 
 
225 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00267955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.16 
 
 
203 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15111  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.27 
 
 
250 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.165078 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09701  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.64 
 
 
218 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1812  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.68 
 
 
202 aa  123  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.9 
 
 
214 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.14 
 
 
206 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1630  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.89 
 
 
214 aa  122  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2490  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.57 
 
 
218 aa  122  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135509  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4420  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.82 
 
 
205 aa  122  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0035  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.76 
 
 
204 aa  122  4e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1366  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.27 
 
 
211 aa  122  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0478  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.6 
 
 
212 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.17 
 
 
204 aa  121  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09731  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.53 
 
 
218 aa  121  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.372545  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1523  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.83 
 
 
202 aa  121  9e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1572  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.83 
 
 
205 aa  121  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.52 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1388  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.36 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01770  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.45 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.08 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0073  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.99 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>