More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_08731 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_08731  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
213 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15111  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.73 
 
 
250 aa  241  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.165078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0478  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.94 
 
 
212 aa  228  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.77 
 
 
230 aa  226  2e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0394188  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0319  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.11 
 
 
232 aa  221  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.0027967  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1129  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.49 
 
 
214 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0564  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.25 
 
 
218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513649  normal  0.0898016 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09921  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.71 
 
 
232 aa  219  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.337887 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1102  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.03 
 
 
214 aa  218  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4633  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.51 
 
 
239 aa  217  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614886  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0039  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48 
 
 
225 aa  214  8e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1388  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.81 
 
 
186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0958  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.57 
 
 
209 aa  202  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.779009  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09681  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.59 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4900  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.28 
 
 
410 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367196 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0909  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.57 
 
 
244 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09701  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.1 
 
 
218 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09731  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.65 
 
 
218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.372545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4977  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.51 
 
 
195 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.07 
 
 
218 aa  186  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.51 
 
 
195 aa  185  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.51 
 
 
206 aa  184  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192447  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.51 
 
 
195 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0269  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.51 
 
 
195 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0297  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.51 
 
 
195 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0329  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.51 
 
 
195 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.32 
 
 
206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0343  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.94 
 
 
195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0326  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.94 
 
 
195 aa  182  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0278  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.94 
 
 
195 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0272  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.94 
 
 
195 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.94 
 
 
206 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.77 
 
 
204 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.8 
 
 
204 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1630  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.76 
 
 
214 aa  175  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.2 
 
 
206 aa  174  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000116567  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0276  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.01 
 
 
195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.11 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2208  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.2 
 
 
224 aa  170  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.128407  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.11 
 
 
205 aa  169  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.43 
 
 
211 aa  168  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1417  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.45 
 
 
205 aa  168  7e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000602325  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1776  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.86 
 
 
213 aa  167  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000344484  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.3 
 
 
222 aa  164  6.9999999999999995e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2609  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.04 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.5 
 
 
225 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1130  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.75 
 
 
195 aa  162  3e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861334  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2448  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.77 
 
 
222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.325008  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2703  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.8 
 
 
225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00267955  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2835  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.5 
 
 
224 aa  161  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.29 
 
 
220 aa  161  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1890  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.62 
 
 
213 aa  160  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.505321 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.14 
 
 
214 aa  159  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.259794  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0532  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.43 
 
 
202 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00415647  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.93 
 
 
225 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.364169  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.37 
 
 
210 aa  159  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2989  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.95 
 
 
213 aa  157  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1138  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.57 
 
 
210 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.89 
 
 
208 aa  157  1e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.147128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.66 
 
 
194 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.29 
 
 
203 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002780  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.79 
 
 
220 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1976  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.63 
 
 
208 aa  156  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04220  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, formyltetrahydrofolate-dependent  39.77 
 
 
212 aa  155  4e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0515  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.98 
 
 
226 aa  155  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.549179 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0764  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.94 
 
 
203 aa  154  8e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.53 
 
 
212 aa  154  9e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.53 
 
 
212 aa  154  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.53 
 
 
212 aa  154  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02392  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.53 
 
 
212 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1169  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.53 
 
 
212 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2783  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.53 
 
 
212 aa  152  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.154299  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.12 
 
 
215 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.91 
 
 
224 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02354  hypothetical protein  39.53 
 
 
212 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110228  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0726  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.22 
 
 
196 aa  153  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000428099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1176  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.53 
 
 
212 aa  152  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2874  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.53 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.551814  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2635  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.53 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0999  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.23 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.797413  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.38 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.53 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3723  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.53 
 
 
212 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.160201  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.95 
 
 
212 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2696  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.95 
 
 
212 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2760  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.95 
 
 
212 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.95 
 
 
213 aa  152  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2869  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.95 
 
 
212 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1477  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.74 
 
 
200 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.63 
 
 
222 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.29 
 
 
214 aa  151  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0253  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.36 
 
 
229 aa  150  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.41 
 
 
222 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.14 
 
 
217 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.63 
 
 
222 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.5 
 
 
214 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0677  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.46 
 
 
225 aa  150  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.744174  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.21 
 
 
212 aa  149  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4216  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.98 
 
 
217 aa  149  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.298326  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.08 
 
 
212 aa  149  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>