More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3996 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3996  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
198 aa  381  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00211251  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28120  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  67.38 
 
 
228 aa  225  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1247  putative phosphoribosylglycinamide formyltransferase  66.84 
 
 
206 aa  223  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.378039  normal  0.01712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0659  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  66.14 
 
 
219 aa  223  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.48364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4216  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.7 
 
 
217 aa  221  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.298326  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0737  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  68.28 
 
 
213 aa  219  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.407866  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2533  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  65.59 
 
 
218 aa  217  8.999999999999998e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272772  normal  0.391268 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04480  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  67.03 
 
 
187 aa  216  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6504  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  66.14 
 
 
211 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7981  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60 
 
 
253 aa  212  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3584  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.93 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0417204  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1088  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.61 
 
 
187 aa  211  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3965  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.38 
 
 
215 aa  211  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07800  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, formyltetrahydrofolate-dependent  65.03 
 
 
209 aa  208  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.463663  normal  0.355884 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3807  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.49 
 
 
206 aa  208  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1164  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.98 
 
 
188 aa  207  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000485336 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4198  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60 
 
 
206 aa  207  9e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0718234  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4320  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.98 
 
 
209 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802678  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4406  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.98 
 
 
209 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.98 
 
 
209 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04960  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.04 
 
 
205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0383  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.33 
 
 
202 aa  195  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4857  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.78 
 
 
218 aa  194  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178721  normal  0.189612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5974  phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase  59.57 
 
 
828 aa  193  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0783963  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10974  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  64.94 
 
 
215 aa  193  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0809236  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1874  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  65.61 
 
 
218 aa  191  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0142355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1271  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.64 
 
 
208 aa  189  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246325  normal  0.912887 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0677  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.95 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.744174  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24110  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.44 
 
 
202 aa  187  8e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871866  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2573  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.27 
 
 
195 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0610  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.61 
 
 
213 aa  185  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0656  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.14 
 
 
216 aa  182  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4420  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.34 
 
 
205 aa  179  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1890  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.71 
 
 
213 aa  175  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.505321 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1366  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.24 
 
 
211 aa  175  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3013  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.38 
 
 
211 aa  171  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000892633  hitchhiker  0.00295616 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3305  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.04 
 
 
204 aa  171  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.58 
 
 
203 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
212 aa  165  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0278  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.58 
 
 
195 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0326  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.62 
 
 
195 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.62 
 
 
195 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0269  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.62 
 
 
195 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0297  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.62 
 
 
195 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0329  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.62 
 
 
195 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.62 
 
 
195 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0272  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.62 
 
 
195 aa  158  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.85 
 
 
205 aa  158  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
218 aa  158  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.71 
 
 
205 aa  157  8e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0343  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.58 
 
 
195 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4977  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.58 
 
 
195 aa  155  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1417  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.81 
 
 
205 aa  154  9e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000602325  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1976  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.73 
 
 
208 aa  152  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0532  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.86 
 
 
202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00415647  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3760  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.81 
 
 
205 aa  151  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234419  normal  0.638022 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0276  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.17 
 
 
195 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.33 
 
 
212 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.14 
 
 
211 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.17 
 
 
206 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000116567  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.33 
 
 
212 aa  149  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.33 
 
 
212 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.99 
 
 
206 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.44 
 
 
220 aa  148  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.82 
 
 
215 aa  148  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.86 
 
 
206 aa  148  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.51 
 
 
206 aa  147  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2993  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.33 
 
 
204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.86 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0457  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.62 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0035  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.62 
 
 
204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.73 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192447  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.77 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.33 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.15 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.400719 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1812  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.34 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2208  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.68 
 
 
224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.128407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1063  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.89 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.66 
 
 
202 aa  145  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.64 
 
 
194 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1776  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.86 
 
 
213 aa  144  8.000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000344484  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1531  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.95 
 
 
197 aa  143  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.468098  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1630  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.17 
 
 
214 aa  142  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1824  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.09 
 
 
218 aa  143  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00661254  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2609  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.33 
 
 
225 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0564  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.89 
 
 
218 aa  142  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513649  normal  0.0898016 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.08 
 
 
313 aa  142  5e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.14 
 
 
205 aa  141  6e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0709  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.14 
 
 
205 aa  141  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04220  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, formyltetrahydrofolate-dependent  42.05 
 
 
212 aa  141  8e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.85 
 
 
225 aa  140  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2693  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.98 
 
 
217 aa  140  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.467272  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2703  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.81 
 
 
225 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00267955  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0073  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.29 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0740  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.41 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1130  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.77 
 
 
195 aa  138  4.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861334  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1673  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.35 
 
 
198 aa  137  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0568966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4633  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.87 
 
 
239 aa  137  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614886  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.28 
 
 
216 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>