More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1271 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1271  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
208 aa  407  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246325  normal  0.912887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7981  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.6 
 
 
253 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3584  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.74 
 
 
208 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0417204  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4216  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.71 
 
 
217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.298326  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04960  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.11 
 
 
205 aa  219  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4198  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.42 
 
 
206 aa  218  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0718234  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.45 
 
 
209 aa  216  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4320  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.45 
 
 
209 aa  216  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802678  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3996  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.64 
 
 
198 aa  216  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00211251  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4406  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.45 
 
 
209 aa  216  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0383  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.7 
 
 
202 aa  211  7e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0659  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.45 
 
 
219 aa  209  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.48364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3807  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.98 
 
 
206 aa  209  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1366  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.72 
 
 
211 aa  208  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0610  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.73 
 
 
213 aa  207  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1247  putative phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.45 
 
 
206 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.378039  normal  0.01712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1088  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.74 
 
 
187 aa  205  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1874  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.58 
 
 
218 aa  204  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0142355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4857  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.42 
 
 
218 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178721  normal  0.189612 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10974  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57 
 
 
215 aa  201  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0809236  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6504  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.33 
 
 
211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1164  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.63 
 
 
188 aa  199  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000485336 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2533  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.97 
 
 
218 aa  192  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272772  normal  0.391268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3013  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.88 
 
 
211 aa  190  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000892633  hitchhiker  0.00295616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3965  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.51 
 
 
215 aa  187  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07800  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, formyltetrahydrofolate-dependent  51.71 
 
 
209 aa  185  5e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.463663  normal  0.355884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3305  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.46 
 
 
204 aa  184  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0656  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.68 
 
 
216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0677  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.5 
 
 
225 aa  181  6e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.744174  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28120  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.5 
 
 
228 aa  178  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0737  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.23 
 
 
213 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.407866  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24110  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.03 
 
 
202 aa  177  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871866  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4420  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.73 
 
 
205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2573  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.3 
 
 
195 aa  171  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04480  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.32 
 
 
187 aa  166  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5974  phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase  50.54 
 
 
828 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0783963  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1417  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.58 
 
 
205 aa  159  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000602325  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3760  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.75 
 
 
205 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234419  normal  0.638022 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.65 
 
 
206 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192447  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.42 
 
 
218 aa  156  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1890  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.5 
 
 
213 aa  155  6e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.505321 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.06 
 
 
205 aa  154  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.2 
 
 
205 aa  153  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2208  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.67 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.128407  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.92 
 
 
206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.49 
 
 
206 aa  152  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000116567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.4 
 
 
206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.06 
 
 
204 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1630  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.91 
 
 
214 aa  149  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.29 
 
 
205 aa  148  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.400719 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0532  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.58 
 
 
202 aa  148  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00415647  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.33 
 
 
211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.58 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.32 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.6 
 
 
215 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.96 
 
 
194 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0457  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.97 
 
 
207 aa  143  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.75 
 
 
203 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0343  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.14 
 
 
195 aa  141  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.72 
 
 
212 aa  141  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4977  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.14 
 
 
195 aa  141  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.46 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0326  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.46 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.63 
 
 
313 aa  140  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.46 
 
 
195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0269  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.46 
 
 
195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0297  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.46 
 
 
195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1976  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.59 
 
 
208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0329  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.46 
 
 
195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0272  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.46 
 
 
195 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.89 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2835  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.9 
 
 
224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.21 
 
 
225 aa  138  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.364169  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0278  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.43 
 
 
195 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0913  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.41 
 
 
210 aa  137  7.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1477  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.61 
 
 
200 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04220  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, formyltetrahydrofolate-dependent  39.6 
 
 
212 aa  137  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.57 
 
 
212 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.57 
 
 
212 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.57 
 
 
212 aa  137  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0276  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.36 
 
 
195 aa  136  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3378  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.93 
 
 
205 aa  136  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.092004 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1776  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.82 
 
 
213 aa  136  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000344484  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2693  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.6 
 
 
217 aa  136  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.467272  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.02 
 
 
214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.31 
 
 
209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2609  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.07 
 
 
225 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2703  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.07 
 
 
225 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00267955  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1523  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.47 
 
 
202 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1572  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.47 
 
 
205 aa  134  8e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.07 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1664  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.58 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278539  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.65 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4054  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.58 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3176  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.4 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.24 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1138  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.96 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0740  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.33 
 
 
209 aa  132  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.16 
 
 
202 aa  132  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2989  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.82 
 
 
213 aa  132  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>