More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28120 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_28120  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
228 aa  443  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2533  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  71.21 
 
 
218 aa  270  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272772  normal  0.391268 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0737  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  69.59 
 
 
213 aa  266  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.407866  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4216  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.45 
 
 
217 aa  239  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.298326  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0659  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.25 
 
 
219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.48364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3584  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.81 
 
 
208 aa  227  9e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0417204  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3996  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  67.38 
 
 
198 aa  225  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00211251  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1247  putative phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.14 
 
 
206 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.378039  normal  0.01712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0677  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.07 
 
 
225 aa  223  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.744174  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7981  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.75 
 
 
253 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3965  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.82 
 
 
215 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07800  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, formyltetrahydrofolate-dependent  61.86 
 
 
209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.463663  normal  0.355884 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3807  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.08 
 
 
206 aa  211  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4198  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.5 
 
 
206 aa  211  7.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0718234  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6504  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.6 
 
 
211 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04960  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.41 
 
 
205 aa  206  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0383  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.36 
 
 
202 aa  205  6e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4320  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.41 
 
 
209 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802678  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.41 
 
 
209 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4406  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.41 
 
 
209 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1164  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.43 
 
 
188 aa  201  7e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000485336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4857  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.07 
 
 
218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178721  normal  0.189612 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2573  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.6 
 
 
195 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1874  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.64 
 
 
218 aa  198  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0142355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0610  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.46 
 
 
213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1366  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.17 
 
 
211 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1088  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.35 
 
 
187 aa  193  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10974  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.59 
 
 
215 aa  192  5e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0809236  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4420  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.53 
 
 
205 aa  186  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3305  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.21 
 
 
204 aa  186  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04480  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.46 
 
 
187 aa  186  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3013  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.22 
 
 
211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000892633  hitchhiker  0.00295616 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.06 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5974  phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase  53.33 
 
 
828 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0783963  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24110  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.24 
 
 
202 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871866  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0656  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.44 
 
 
216 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41 
 
 
205 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.28 
 
 
225 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.18 
 
 
203 aa  168  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2703  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.8 
 
 
225 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00267955  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2609  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.29 
 
 
225 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.77 
 
 
217 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.55 
 
 
211 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1976  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49 
 
 
208 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0326  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.32 
 
 
195 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1890  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.27 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.505321 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.64 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0532  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.92 
 
 
202 aa  166  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00415647  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1417  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.15 
 
 
205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000602325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.78 
 
 
205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.400719 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2208  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.12 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.128407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0278  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.04 
 
 
195 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.57 
 
 
195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0269  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.57 
 
 
195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.57 
 
 
195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0297  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.57 
 
 
195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0329  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.57 
 
 
195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45 
 
 
204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0343  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.04 
 
 
195 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.31 
 
 
206 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0272  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.04 
 
 
195 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0643  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.7 
 
 
217 aa  159  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104742  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.64 
 
 
212 aa  158  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1776  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.8 
 
 
213 aa  158  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000344484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.85 
 
 
206 aa  158  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192447  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.3 
 
 
215 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2693  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.38 
 
 
217 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.467272  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.61 
 
 
205 aa  157  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4977  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.5 
 
 
195 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44 
 
 
204 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.2 
 
 
313 aa  156  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.28 
 
 
225 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.364169  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1824  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.86 
 
 
218 aa  155  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00661254  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5548  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.72 
 
 
220 aa  154  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3760  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.72 
 
 
205 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234419  normal  0.638022 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1812  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.5 
 
 
202 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.01 
 
 
205 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0709  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.01 
 
 
205 aa  153  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0576  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.78 
 
 
221 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.116598 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1271  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.5 
 
 
208 aa  153  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246325  normal  0.912887 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.93 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.826865  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3176  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.88 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.92 
 
 
203 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.84 
 
 
206 aa  152  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.31 
 
 
202 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.9 
 
 
206 aa  149  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000116567  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0276  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.02 
 
 
195 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0126  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.56 
 
 
198 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0913  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.15 
 
 
210 aa  149  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.29 
 
 
206 aa  148  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1630  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.64 
 
 
214 aa  148  7e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2993  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.15 
 
 
212 aa  148  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0999  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.46 
 
 
194 aa  148  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.797413  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43 
 
 
216 aa  147  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2448  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.96 
 
 
222 aa  147  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.325008  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2769  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.23 
 
 
227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0964  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.1 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.56 
 
 
219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1673  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.09 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0568966 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1486  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.28 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000112239  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>