More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50606 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_50606  hypothetical protein  100 
 
 		 472 aa  949    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.862046  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03888  multidrug efflux transporter (Eurofung)  46.83 
 
 		 542 aa  386  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05198  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07320)  32.34 
 
 		 550 aa  182  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00201  MFS multidrug efflux transporter (Eurofung)  29.44 
 
 		 652 aa  178  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.27955 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.32 
 
 		 504 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01766  MFS multidrug efflux transporter (Eurofung)  34.11 
 
 		 636 aa  167  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.35 
 
 		 504 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29 
 
 		 535 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.91 
 
 		 504 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.13 
 
 		 509 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 494 aa  159  8e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.69 
 
 		 509 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.69 
 
 		 509 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.69 
 
 		 504 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  29.64 
 
 		 515 aa  156  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.01 
 
 		 504 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.79 
 
 		 641 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.53 
 
 		 541 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01350  transporter, putative  28.79 
 
 		 582 aa  154  4e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.671168  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.85 
 
 		 509 aa  154  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.85 
 
 		 504 aa  153  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03264  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03320)  27.75 
 
 		 571 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.591417 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02830  multidrug transporter, putative  34.81 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102961  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.18 
 
 		 498 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.48 
 
 		 666 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.05 
 
 		 528 aa  150  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
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NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.57 
 
 		 520 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.89 
 
 		 562 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.78 
 
 		 505 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.16 
 
 		 513 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
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NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  28.87 
 
 		 501 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
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NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.87 
 
 		 530 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.34 
 
 		 538 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.06 
 
 		 593 aa  147  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  29.67 
 
 		 1062 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.67 
 
 		 680 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
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NC_009068  PICST_37347  suppressor of gal11 null  25.16 
 
 		 569 aa  145  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.315077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  27.41 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.57 
 
 		 569 aa  145  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.99 
 
 		 483 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.62 
 
 		 504 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.62 
 
 		 504 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.59 
 
 		 483 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
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NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.96 
 
 		 504 aa  144  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.62 
 
 		 519 aa  143  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.62 
 
 		 504 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.62 
 
 		 504 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_4394  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 538 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.497016  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.38 
 
 		 504 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.38 
 
 		 504 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04180  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08230)  27.92 
 
 		 561 aa  141  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.35 
 
 		 505 aa  141  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299723 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.13 
 
 		 500 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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BN001306  ANIA_02985  MFS drug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08530)  26.69 
 
 		 626 aa  140  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.48 
 
 		 483 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.1 
 
 		 528 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.85 
 
 		 511 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.34 
 
 		 528 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58666  MFS transporter  28.47 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.97 
 
 		 650 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.68 
 
 		 555 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.06 
 
 		 511 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.06 
 
 		 511 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.12 
 
 		 511 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.25 
 
 		 592 aa  137  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.06 
 
 		 511 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  27.43 
 
 		 511 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.61 
 
 		 567 aa  136  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 		 511 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.06 
 
 		 537 aa  136  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  25.29 
 
 		 476 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  25.06 
 
 		 537 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  25.06 
 
 		 537 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  25.06 
 
 		 537 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  25.06 
 
 		 537 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  24.83 
 
 		 537 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.28 
 
 		 537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.87 
 
 		 678 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.35 
 
 		 530 aa  134  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.49 
 
 		 513 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 		 538 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
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NC_006685  CNC03290  tetracycline efflux protein, putative  26.99 
 
 		 652 aa  134  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0454964  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.68 
 
 		 565 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.85 
 
 		 483 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.42 
 
 		 526 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  24.61 
 
 		 537 aa  133  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
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NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.81 
 
 		 513 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  25.81 
 
 		 513 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.81 
 
 		 513 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.81 
 
 		 513 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  25.81 
 
 		 513 aa  133  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.68 
 
 		 539 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.81 
 
 		 513 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.56 
 
 		 513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.33 
 
 		 501 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
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NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.2 
 
 		 685 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009068  PICST_28802  MFS efflux transporter  26.04 
 
 		 565 aa  132  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.211393  normal  0.613875 
 
 
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NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.06 
 
 		 561 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.81 
 
 		 513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
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