More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI01350 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI01350  transporter, putative  100 
 
 
582 aa  1181    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.671168  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03350  multidrug resistance protein fnx1, putative  40.87 
 
 
585 aa  380  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05198  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07320)  34 
 
 
550 aa  262  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01766  MFS multidrug efflux transporter (Eurofung)  33.15 
 
 
636 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06830  multidrug resistance protein fnx1, putative  35.11 
 
 
534 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02560  multidrug resistance protein fnx1, putative  30.5 
 
 
578 aa  238  2e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.777678  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03888  multidrug efflux transporter (Eurofung)  31.75 
 
 
542 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00350  conserved hypothetical protein  35.47 
 
 
442 aa  225  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.157268  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00201  MFS multidrug efflux transporter (Eurofung)  29.57 
 
 
652 aa  209  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.27955 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.02 
 
 
569 aa  194  5e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.49 
 
 
650 aa  194  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.87 
 
 
682 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.87 
 
 
682 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.87 
 
 
682 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.98 
 
 
528 aa  190  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58666  MFS transporter  33.42 
 
 
398 aa  189  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210164  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.28 
 
 
539 aa  189  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.3 
 
 
685 aa  187  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.27 
 
 
530 aa  186  9e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.31 
 
 
697 aa  185  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.38 
 
 
592 aa  184  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.95 
 
 
621 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.63 
 
 
525 aa  182  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.71 
 
 
504 aa  181  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.47 
 
 
504 aa  181  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.46 
 
 
528 aa  180  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.92 
 
 
678 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.74 
 
 
541 aa  178  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.99 
 
 
511 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.94 
 
 
676 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.83 
 
 
565 aa  174  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.69 
 
 
666 aa  174  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.92 
 
 
535 aa  173  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.31 
 
 
504 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.52 
 
 
504 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.31 
 
 
504 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.52 
 
 
504 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.31 
 
 
504 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.31 
 
 
519 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.31 
 
 
504 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.31 
 
 
513 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.57 
 
 
680 aa  170  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.3 
 
 
685 aa  170  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.53 
 
 
538 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.75 
 
 
504 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.9 
 
 
504 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  27.76 
 
 
507 aa  169  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  31.42 
 
 
501 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.92 
 
 
509 aa  169  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  25.29 
 
 
535 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.13 
 
 
554 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.72 
 
 
504 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1147  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.22 
 
 
702 aa  167  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.624322  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.29 
 
 
509 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.91 
 
 
539 aa  166  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  28.86 
 
 
666 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  28.29 
 
 
513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  28.29 
 
 
513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.29 
 
 
513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  27.47 
 
 
507 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.29 
 
 
513 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.29 
 
 
513 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.06 
 
 
513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.84 
 
 
513 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.84 
 
 
513 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2560  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.01 
 
 
557 aa  165  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.577395  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.84 
 
 
513 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.29 
 
 
513 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.5 
 
 
501 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  30.34 
 
 
515 aa  163  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  25.46 
 
 
1062 aa  163  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.02 
 
 
522 aa  163  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.45 
 
 
509 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.45 
 
 
509 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.43 
 
 
567 aa  162  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.48 
 
 
538 aa  162  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0388  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.62 
 
 
532 aa  161  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.95 
 
 
537 aa  161  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.59 
 
 
537 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.05 
 
 
504 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.07 
 
 
480 aa  160  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08095  MFS toxin efflux pump (AflT), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12620)  25.33 
 
 
539 aa  160  7e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00148493  normal  0.123632 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.3 
 
 
538 aa  160  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.26 
 
 
514 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  24.77 
 
 
537 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50606  hypothetical protein  28.57 
 
 
472 aa  159  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.862046  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  24.77 
 
 
537 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.44 
 
 
615 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.23 
 
 
593 aa  159  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.22 
 
 
520 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.41 
 
 
558 aa  158  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  25.76 
 
 
476 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.3 
 
 
505 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299723 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  24.59 
 
 
537 aa  157  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04180  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08230)  26.26 
 
 
561 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.81 
 
 
526 aa  157  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  25.58 
 
 
537 aa  156  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  25.58 
 
 
537 aa  156  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  25.58 
 
 
537 aa  156  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.26 
 
 
479 aa  156  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>