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for query gene CNK02830 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006680  CNK02830  multidrug transporter, putative  100 
 
 		 358 aa  718    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102961  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03888  multidrug efflux transporter (Eurofung)  34.64 
 
 		 542 aa  206  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00201  MFS multidrug efflux transporter (Eurofung)  35 
 
 		 652 aa  169  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.27955 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05198  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07320)  34.07 
 
 		 550 aa  169  7e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.13 
 
 		 569 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.91 
 
 		 528 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 494 aa  155  7e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.38 
 
 		 519 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.03 
 
 		 535 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.87 
 
 		 505 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50606  hypothetical protein  34.81 
 
 		 472 aa  148  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.862046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.57 
 
 		 528 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.34 
 
 		 680 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.52 
 
 		 697 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02985  MFS drug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08530)  29.71 
 
 		 626 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.42 
 
 		 685 aa  145  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.61 
 
 		 539 aa  145  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
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NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.95 
 
 		 592 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.81 
 
 		 511 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.38 
 
 		 513 aa  143  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.93 
 
 		 504 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.38 
 
 		 513 aa  143  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  28.27 
 
 		 515 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  28.88 
 
 		 501 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
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BN001307  ANIA_01766  MFS multidrug efflux transporter (Eurofung)  32.6 
 
 		 636 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 		 530 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.31 
 
 		 682 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
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NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.31 
 
 		 682 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.31 
 
 		 682 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.07 
 
 		 526 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
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NC_007964  Nham_1405  major facilitator transporter  31.8 
 
 		 519 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.06 
 
 		 513 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  29.06 
 
 		 513 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  29.06 
 
 		 513 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.06 
 
 		 513 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.06 
 
 		 513 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.9 
 
 		 565 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.06 
 
 		 513 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
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NC_006691  CNF00350  conserved hypothetical protein  32.1 
 
 		 442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.157268  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.87 
 
 		 498 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.06 
 
 		 513 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
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NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.74 
 
 		 530 aa  139  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 504 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.87 
 
 		 483 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.15 
 
 		 685 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  30.62 
 
 		 537 aa  139  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
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NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.42 
 
 		 672 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.96 
 
 		 538 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.62 
 
 		 483 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
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NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.61 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  26.09 
 
 		 507 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.94 
 
 		 565 aa  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.19 
 
 		 513 aa  136  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  26.52 
 
 		 507 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.67 
 
 		 525 aa  136  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
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BN001307  ANIA_01481  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14490)  26.54 
 
 		 572 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1199  putative multidrug transporter  28.37 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467724  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.28 
 
 		 666 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.19 
 
 		 650 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.69 
 
 		 509 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4394  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 538 aa  133  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.497016  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0554  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 531 aa  133  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  28.57 
 
 		 1062 aa  133  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_2795  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 531 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  24.92 
 
 		 537 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  24.92 
 
 		 537 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.92 
 
 		 537 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  24.92 
 
 		 476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  24.92 
 
 		 537 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0637  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.74 
 
 		 531 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  24.92 
 
 		 537 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.22 
 
 		 500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  24.92 
 
 		 537 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0388  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.43 
 
 		 532 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 504 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 531 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2133  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 531 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518616  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2745  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 531 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.67 
 
 		 483 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  24.92 
 
 		 537 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.82 
 
 		 541 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.67 
 
 		 483 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
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NC_014211  Ndas_5486  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 584 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.75 
 
 		 561 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.23 
 
 		 537 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 531 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 		 528 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.12 
 
 		 511 aa  129  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4266  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.82 
 
 		 526 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.657921 
 
 
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NC_010678  Rpic_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.82 
 
 		 526 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326396  normal  1 
 
 
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NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.3 
 
 		 621 aa  129  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.66 
 
 		 504 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  26.91 
 
 		 511 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.31 
 
 		 504 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
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NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.66 
 
 		 567 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
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NC_007651  BTH_I0541  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.13 
 
 		 549 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 676 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.25 
 
 		 511 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
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NC_013530  Xcel_2111  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.52 
 
 		 528 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534364  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 531 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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