More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45918 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_45918  predicted protein  100 
 
 
288 aa  593  1e-169  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.997663  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
246 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 
229 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 
246 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
237 aa  89  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.19 
 
 
245 aa  86.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035289  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409582  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.97 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5116  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.64 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.71 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  29.52 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  28.63 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1818  short chain dehydrogenase  28.63 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44630  predicted protein  30.96 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0847345  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5377  putative retinol dehydrogenase  28.32 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.637386  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01679  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase  27.18 
 
 
242 aa  71.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.59 
 
 
237 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.28 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.99 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.14 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120829  normal  0.282186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.42 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  normal  0.454063 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3562  short chain dehydrogenase  29.39 
 
 
236 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1782  short chain dehydrogenase  28.15 
 
 
236 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.65 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  30.3 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7619  short chain oxidoreductase  33.19 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493234  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2677  putative short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  28.68 
 
 
245 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334903  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
241 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
237 aa  67  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 
234 aa  67  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 
234 aa  67  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.11 
 
 
238 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07999  conserved hypothetical protein  30.09 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.71 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.593467  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  29.91 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.03 
 
 
265 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  31.14 
 
 
252 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
244 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 
281 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  29.46 
 
 
252 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  29.46 
 
 
252 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 
252 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  30.7 
 
 
252 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.19 
 
 
243 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.23 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.281486  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  29.82 
 
 
252 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.87 
 
 
227 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20980  putative short chain dehydrogenas  28.57 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696574  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
297 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.580908  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.83 
 
 
245 aa  60.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 
252 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27 
 
 
309 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 
280 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.67 
 
 
256 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.434402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 
252 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.22 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0227742 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
319 aa  59.7  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  33.09 
 
 
244 aa  59.7  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11130  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.65 
 
 
255 aa  59.3  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.33 
 
 
246 aa  59.3  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  28.19 
 
 
248 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
245 aa  58.9  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 
272 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1607  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.67 
 
 
248 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000319104  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.44 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230027  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
286 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6072  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.79 
 
 
256 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.56 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.56 
 
 
235 aa  57.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  23.57 
 
 
252 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
275 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02039  short chain oxidoreductase (CsgA), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00910)  26.53 
 
 
251 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.049775  normal  0.21203 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.22 
 
 
248 aa  57.4  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1344  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.07 
 
 
246 aa  57.4  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.118162  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0453  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.79 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.465318  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
249 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.14 
 
 
266 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.2 
 
 
269 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  32.19 
 
 
272 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05161  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  30.53 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.426884  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
232 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02369  short chain dehydrogenase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15350)  26.27 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.406317 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02950  cytoplasm protein, putative  24.63 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14920  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.89 
 
 
247 aa  57  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0427  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.76 
 
 
452 aa  57  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.412376  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1381  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  28.07 
 
 
248 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.049098  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2760  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.7 
 
 
241 aa  56.2  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>