237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45887 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_45887  predicted protein  100 
 
 		 524 aa  1016    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12346  predicted protein  41.95 
 
 		 408 aa  300  4e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2540  predicted protein  32.66 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2427  LrgB-like protein  33.05 
 
 		 241 aa  87.8  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  31.22 
 
 		 239 aa  87.8  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0422  LrgB family protein  39.07 
 
 		 231 aa  86.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408547  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  31.06 
 
 		 245 aa  85.9  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  36.18 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3993  LrgB family protein  34.91 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.479207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2907  LrgB family protein  31.16 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4427  LrgB family protein  35.04 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113499  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2670  hypothetical protein  40.85 
 
 		 240 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.275457 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22940  conserved hypothetical protein TIGR00659  33.78 
 
 		 244 aa  82.8  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1695  hypothetical protein  38.57 
 
 		 228 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1794  LrgB-like protein  30.88 
 
 		 242 aa  82.4  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0412  LrgB family protein  37.87 
 
 		 241 aa  82.4  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.579768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19690  hypothetical protein  37.86 
 
 		 228 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0546  LrgB family protein  39.07 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415827  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  35.29 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1096  hypothetical protein  35.85 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  35.85 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  34.94 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0272  hypothetical protein  35.82 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  36.36 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0267  hypothetical protein  35.82 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0021  LrgB family protein  35.77 
 
 		 233 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  36.88 
 
 		 238 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  36.25 
 
 		 238 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  36.88 
 
 		 238 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  36.88 
 
 		 238 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3388  LrgB family protein  32.31 
 
 		 238 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0342  hypothetical protein  36.76 
 
 		 235 aa  79  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4980  LrgB-like protein  35.67 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  38.41 
 
 		 231 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02117  murein hydrolase export regulator  35.66 
 
 		 225 aa  78.6  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7210  putative murein hydrolase export regulator, LrgB family protein  37.31 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  38.93 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0273  LrgB family protein  34.97 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0268732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  38.93 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  38.93 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  38.93 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0492  LrgB-like protein  35.33 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1686  hypothetical protein  38.81 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795605  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0333  LrgB-like protein  35.87 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4532  lrgB-like family protein  31.79 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.889737  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4616  LrgB family protein  31.79 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4525  LrgB family protein  31.79 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4618  LrgB family protein  31.79 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  35.8 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  35.8 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  35.8 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0736  hypothetical protein  35.71 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1853  LrgB family protein  39.87 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  35.8 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  35.8 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  30.2 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  35.8 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  35.8 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  35.8 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0666  LrgB family protein  39.05 
 
 		 238 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0326  hypothetical protein  36.03 
 
 		 235 aa  75.5  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  32.34 
 
 		 240 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1577  LrgB family protein  36.5 
 
 		 230 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.4351e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3735  LrgB family protein  34.76 
 
 		 239 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0061  LrgB family protein  33.8 
 
 		 240 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3928  LrgB family protein  39.88 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.337837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0623  LrgB-like protein  35.48 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2740  LrgB family protein  31.95 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003698  lrgA-associated membrane protein LrgB  35.51 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0028  LrgB-like protein  33.8 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0042  LrgB family protein  33.8 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0888  LrgB family protein  31.84 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3356  LrgB family protein  31.69 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.591604  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3644  LrgB family protein  38.01 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3937  LrgB family protein  38.01 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0034  LrgB family protein  33.1 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0045  LrgB family protein  33.83 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3226  LrgB-like protein  33.83 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.144978 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1010  LrgB family protein  31.21 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  35.66 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2968  hypothetical protein  34.11 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45272  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2116  hypothetical protein  32.18 
 
 		 229 aa  73.2  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0001189  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3283  LrgB family protein  32.67 
 
 		 240 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.381562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2765  hypothetical protein  34.04 
 
 		 231 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0819  LrgB family protein  36.09 
 
 		 224 aa  73.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.061161  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  35.88 
 
 		 241 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0043  LrgB family protein  33.08 
 
 		 240 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.690541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1322  LrgB family protein  31.06 
 
 		 232 aa  72.8  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0128  LrgB family protein  31.58 
 
 		 239 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4667  LrgB family protein  31.21 
 
 		 229 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0853  hypothetical protein  31.55 
 
 		 224 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1067  LrgB family protein  34.34 
 
 		 225 aa  72.4  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4609  LrgB family protein  34.33 
 
 		 228 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3808  LrgB family protein  37.33 
 
 		 238 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3376  murein hydrolase export regulator  31.15 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.508194  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4337  LrgB family protein  31.85 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.4746  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1569  hypothetical protein  37.4 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1497  hypothetical protein  31.14 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2563  hypothetical protein  32.76 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2616  hypothetical protein  32.76 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>