242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1067 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1067  LrgB family protein  100 
 
 		 225 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1497  hypothetical protein  38.91 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2968  hypothetical protein  39.37 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45272  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2448  hypothetical protein  40.18 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  38.01 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  36.2 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  36.2 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  36.2 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  36.2 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  36.2 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  36.2 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  36.2 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  36.2 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1569  hypothetical protein  39.37 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  38.07 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  38.07 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  37.1 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  38.07 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  37.1 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  38.07 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  38.07 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  36.65 
 
 		 231 aa  148  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1236  hypothetical protein  37.91 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2543  hypothetical protein  39.82 
 
 		 231 aa  142  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0853  hypothetical protein  38.03 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2765  hypothetical protein  37.44 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02117  murein hydrolase export regulator  38.97 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0412  LrgB family protein  38.3 
 
 		 241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.579768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  38.66 
 
 		 245 aa  132  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003698  lrgA-associated membrane protein LrgB  37.5 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  37.67 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  34.62 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3735  LrgB family protein  37.85 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  35.43 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  35.43 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1794  LrgB-like protein  36.84 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0021  LrgB family protein  33.18 
 
 		 233 aa  118  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3676  LrgB family protein  31.28 
 
 		 230 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000265737  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  35.43 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  30.95 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  36.77 
 
 		 244 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  36.77 
 
 		 244 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0819  LrgB family protein  32.29 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.061161  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  35.75 
 
 		 241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1954  LrgB family protein  37.62 
 
 		 239 aa  115  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  34.7 
 
 		 244 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0736  hypothetical protein  30.95 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  35.48 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3808  LrgB family protein  34.83 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5235  hypothetical protein  30.88 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  34.12 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5281  hypothetical protein  30.88 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000270926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5706  hypothetical protein  30.88 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4924  LrgB family protein  30.88 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609983  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  33.03 
 
 		 240 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  31.34 
 
 		 238 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2427  LrgB-like protein  34.98 
 
 		 241 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  31.34 
 
 		 238 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4959  murein hydrolase export regulator  30.88 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0594327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4811  murein hydrolase export regulator  30.88 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.977744  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  33.51 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4821  murein hydrolase export regulator  30.88 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0719494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5217  hypothetical protein  30.88 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5337  hypothetical protein  30.88 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.247434  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  30.85 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  31.88 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2740  LrgB family protein  32.11 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2563  hypothetical protein  28.44 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2616  hypothetical protein  28.44 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2322  LrgB family protein  31.98 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000117788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4427  LrgB family protein  31.42 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113499  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7210  putative murein hydrolase export regulator, LrgB family protein  31.13 
 
 		 236 aa  108  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4980  LrgB-like protein  31.44 
 
 		 238 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235644  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2670  hypothetical protein  39.88 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.275457 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1229  LrgB-like family protein  34.02 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  34.2 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3356  LrgB family protein  32.52 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.591604  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0707  LrgB family protein  34.39 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000904549  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2116  hypothetical protein  28.44 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0001189  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1010  LrgB family protein  32.2 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1268  LrgB family protein  34.69 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  29.85 
 
 		 238 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5246  hypothetical protein  33.15 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206214  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03101  LrgB-like protein  32.47 
 
 		 236 aa  105  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0895138  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  33.33 
 
 		 246 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1096  hypothetical protein  31.4 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1359  LrgB family protein  35.29 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957145  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08310  membrane protein, LrgB family  30.37 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.298678  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0156  LrgB family protein  35.23 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0128  LrgB family protein  37.97 
 
 		 239 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3293  LrgB-like protein  35.45 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1948  lrgB-like family protein  32.55 
 
 		 236 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19690  hypothetical protein  30.14 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1853  LrgB family protein  37.06 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0074  LrgB family protein  32.14 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2236  lrgB-like family protein  32.55 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0422  LrgB family protein  31.05 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408547  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1695  hypothetical protein  30.59 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0666  LrgB family protein  33.49 
 
 		 238 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3687  hypothetical protein  32.52 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>