244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0707 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0707  LrgB family protein  100 
 
 		 230 aa  447  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000904549  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  48.91 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1948  lrgB-like family protein  50.91 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2236  lrgB-like family protein  50.91 
 
 		 236 aa  192  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  46.26 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00860  putative effector of murein hydrolase  43.66 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2909  LrgB family protein  45.71 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1359  LrgB family protein  42.79 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957145  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1949  LrgB family protein  42.79 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0159  LrgB family protein  40 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  35 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  34.09 
 
 		 244 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0811  putative effector of murein hydrolase  37.21 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00607912  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  32.72 
 
 		 244 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  32.72 
 
 		 244 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5571  antiholin-like protein LrgB  38.92 
 
 		 230 aa  148  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5293  antiholin-like protein LrgB  38.92 
 
 		 230 aa  148  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5120  antiholin-like protein LrgB  38.92 
 
 		 230 aa  148  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5135  antiholin-like protein LrgB  38.92 
 
 		 230 aa  148  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0238416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5563  antiholin-like protein LrgB  38.92 
 
 		 230 aa  148  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5386  antiholin-like protein LrgB  38.92 
 
 		 230 aa  148  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.674425  normal  0.703231 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5689  antiholin-like protein LrgB  38.92 
 
 		 230 aa  148  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5534  antiholin-like protein LrgB  38.92 
 
 		 230 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5619  antiholin-like protein LrgB  38.92 
 
 		 230 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3956  antiholin-like protein LrgB  37.93 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1482  putative effector of murein hydrolase  40.27 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0187991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5232  antiholin-like protein LrgB  38.42 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2322  LrgB family protein  35.47 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000117788  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  34.56 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  34.7 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  30.26 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22940  conserved hypothetical protein TIGR00659  34.7 
 
 		 244 aa  142  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  34.55 
 
 		 244 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  34.55 
 
 		 244 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1096  hypothetical protein  34.27 
 
 		 236 aa  141  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3704  hypothetical protein  36.79 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3376  murein hydrolase export regulator  36.27 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.508194  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0074  LrgB family protein  36.12 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  33.8 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3356  LrgB family protein  36.27 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.591604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3459  hypothetical protein  36.27 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.807619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3425  murein hydrolase export regulator  36.27 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0481029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3731  hypothetical protein  36.27 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3687  hypothetical protein  36.27 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353433 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2027  antiholin-like protein LrgB  35.55 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.69711  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  34.56 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3778  hypothetical protein  33.18 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  29.82 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3711  hypothetical protein  36.27 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.34067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1536  hypothetical protein  33.18 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.020516 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08310  membrane protein, LrgB family  35.85 
 
 		 238 aa  136  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.298678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  30.26 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  35.21 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  35.21 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0819  LrgB family protein  30.19 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.061161  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  34.74 
 
 		 231 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1268  LrgB family protein  35.64 
 
 		 244 aa  134  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2563  hypothetical protein  35.5 
 
 		 229 aa  134  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2968  hypothetical protein  38.62 
 
 		 232 aa  134  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2616  hypothetical protein  35.5 
 
 		 229 aa  134  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1497  hypothetical protein  38.1 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0248  antiholin-like protein LrgB  34.78 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0254  antiholin-like protein LrgB  34.78 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  33.02 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  33.49 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  33.49 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  33.49 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  34.12 
 
 		 238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  33.49 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  33.49 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2500  LrgB family protein  32.42 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.541582 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  33.49 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  33.49 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2906  LrgB family protein  32.42 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2448  hypothetical protein  34.27 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0830  LrgB family protein  32.23 
 
 		 229 aa  132  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0267  hypothetical protein  32.7 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  33.65 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  33.65 
 
 		 238 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2907  LrgB family protein  31.47 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1569  hypothetical protein  40.56 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  33.65 
 
 		 238 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0021  LrgB family protein  33.03 
 
 		 233 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0272  hypothetical protein  32.7 
 
 		 235 aa  132  6e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1794  LrgB-like protein  34.59 
 
 		 242 aa  132  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2427  LrgB-like protein  33.48 
 
 		 241 aa  131  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3808  LrgB family protein  35.68 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3003  LrgB family protein  32.46 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  34.33 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  37.11 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  37.11 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  37.11 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1148  hypothetical protein  37.16 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000875943  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1236  hypothetical protein  34.27 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7210  putative murein hydrolase export regulator, LrgB family protein  31.63 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  33.16 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  37.11 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0853  hypothetical protein  36.5 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  37.11 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>