242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1482 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1482  putative effector of murein hydrolase  100 
 
 
231 aa  447  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0187991  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1148  hypothetical protein  63.64 
 
 
231 aa  263  1e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000875943  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0811  putative effector of murein hydrolase  55.16 
 
 
232 aa  236  3e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00607912  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0159  LrgB family protein  39.56 
 
 
235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  39.09 
 
 
238 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2236  lrgB-like family protein  38.46 
 
 
236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1948  lrgB-like family protein  38.46 
 
 
236 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0707  LrgB family protein  40.27 
 
 
230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000904549  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1359  LrgB family protein  38.67 
 
 
230 aa  152  4e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957145  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  37.16 
 
 
245 aa  150  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  36 
 
 
239 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  35.71 
 
 
231 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  35.71 
 
 
245 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  35.84 
 
 
244 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  36.04 
 
 
236 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1096  hypothetical protein  36.57 
 
 
236 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  35.4 
 
 
244 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  35.4 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00860  putative effector of murein hydrolase  35.02 
 
 
234 aa  135  4e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  34.96 
 
 
244 aa  135  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  34.38 
 
 
241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1949  LrgB family protein  36.41 
 
 
236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  33.48 
 
 
238 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3808  LrgB family protein  36 
 
 
238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22940  conserved hypothetical protein TIGR00659  35.87 
 
 
244 aa  132  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  36.75 
 
 
231 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.640575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  33.33 
 
 
238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  33.48 
 
 
238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  36.32 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  36.32 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  33.49 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  36.32 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  36.32 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  36.32 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  36.32 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  36.32 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2909  LrgB family protein  37.73 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2907  LrgB family protein  37.99 
 
 
229 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  35.9 
 
 
231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1577  LrgB family protein  34.42 
 
 
230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.4351e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5232  antiholin-like protein LrgB  34.15 
 
 
230 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  33.33 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5571  antiholin-like protein LrgB  34.15 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5619  antiholin-like protein LrgB  34.15 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5534  antiholin-like protein LrgB  34.15 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5293  antiholin-like protein LrgB  34.15 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5120  antiholin-like protein LrgB  34.15 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5135  antiholin-like protein LrgB  34.15 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0238416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5386  antiholin-like protein LrgB  34.15 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.674425  normal  0.703231 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5563  antiholin-like protein LrgB  34.15 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5689  antiholin-like protein LrgB  34.15 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  32.44 
 
 
240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  33.33 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4980  LrgB-like protein  31.88 
 
 
238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235644  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08310  membrane protein, LrgB family  33.04 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.298678  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0819  LrgB family protein  31.8 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.061161  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  33.48 
 
 
241 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2322  LrgB family protein  35.45 
 
 
225 aa  125  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000117788  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2740  LrgB family protein  32.57 
 
 
238 aa  125  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0021  LrgB family protein  33.18 
 
 
233 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2977  LrgB family protein  34.93 
 
 
241 aa  125  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  36 
 
 
231 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  36 
 
 
231 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1497  hypothetical protein  38.92 
 
 
231 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  36 
 
 
231 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2427  LrgB-like protein  36.04 
 
 
241 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2968  hypothetical protein  38.92 
 
 
232 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45272  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  36 
 
 
231 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  36 
 
 
231 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0736  hypothetical protein  31.67 
 
 
238 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3735  LrgB family protein  35.81 
 
 
239 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105665  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2405  LrgB family protein  34.5 
 
 
241 aa  122  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  34.51 
 
 
244 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  34.51 
 
 
244 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2906  LrgB family protein  33.48 
 
 
243 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3704  hypothetical protein  36.02 
 
 
225 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2500  LrgB family protein  33.48 
 
 
243 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.541582 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3676  LrgB family protein  31.19 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000265737  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  35.09 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2448  hypothetical protein  37.25 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3459  hypothetical protein  36.02 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.807619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3425  murein hydrolase export regulator  36.02 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0481029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3731  hypothetical protein  36.02 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3687  hypothetical protein  36.02 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353433 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3956  antiholin-like protein LrgB  32.2 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2670  hypothetical protein  34.82 
 
 
240 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.275457 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3644  LrgB family protein  32 
 
 
238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3937  LrgB family protein  32 
 
 
238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3711  hypothetical protein  36.02 
 
 
225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.34067  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0888  LrgB family protein  34.92 
 
 
243 aa  118  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0448  LrgB family protein  35.75 
 
 
240 aa  118  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0074  LrgB family protein  33.19 
 
 
230 aa  118  7.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3376  murein hydrolase export regulator  35.55 
 
 
225 aa  118  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.508194  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3003  LrgB family protein  35.86 
 
 
237 aa  118  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003698  lrgA-associated membrane protein LrgB  34.69 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  33.94 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  33.94 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4811  murein hydrolase export regulator  33.48 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.977744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4821  murein hydrolase export regulator  33.48 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0719494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5217  hypothetical protein  33.48 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>