243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0830 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0830  LrgB family protein  100 
 
 		 229 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3024  LrgB family protein  61.14 
 
 		 239 aa  254  8e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0955  LrgB family protein  63.39 
 
 		 239 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0990  LrgB family protein  63.39 
 
 		 239 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3049  LrgB family protein  66.19 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00126242  normal  0.0295055 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0976  LrgB family protein  63.39 
 
 		 239 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2926  hypothetical protein  69.34 
 
 		 229 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000884331  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3388  LrgB family protein  63.39 
 
 		 239 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0886  LrgB family protein  66.19 
 
 		 244 aa  252  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00106123  normal  0.143935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0923  LrgB family protein  66.83 
 
 		 244 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.47828  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1048  hypothetical protein  66.35 
 
 		 244 aa  249  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0892  LrgB family protein  62.28 
 
 		 229 aa  247  9e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0903  LrgB family protein  64.63 
 
 		 229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000464548 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4427  LrgB family protein  49.56 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113499  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0422  LrgB family protein  45.83 
 
 		 231 aa  181  9.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408547  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0342  hypothetical protein  44.91 
 
 		 235 aa  178  8e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0326  hypothetical protein  44.44 
 
 		 235 aa  174  9e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568511  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0273  LrgB family protein  44.84 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0268732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1695  hypothetical protein  42.54 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19690  hypothetical protein  41.67 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0061  LrgB family protein  50 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0028  LrgB-like protein  50 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0034  LrgB family protein  50 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0042  LrgB family protein  50 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2920  LrgB family protein  47.09 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0043  LrgB family protein  50 
 
 		 240 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.690541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4532  lrgB-like family protein  44.3 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.889737  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4618  LrgB family protein  44.3 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4525  LrgB family protein  44.3 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4616  LrgB family protein  44.3 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1607  LrgB-like protein  42.25 
 
 		 241 aa  168  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.884781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3226  LrgB-like protein  50 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.144978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7210  putative murein hydrolase export regulator, LrgB family protein  45.33 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0045  LrgB family protein  49.55 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1322  LrgB family protein  38.5 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0272  hypothetical protein  43.63 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0267  hypothetical protein  43.63 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4667  LrgB family protein  43.86 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2322  LrgB family protein  40 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000117788  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0025  hypothetical protein  47.25 
 
 		 240 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2767  hypothetical protein  47.25 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3499  hypothetical protein  47.25 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1870  hypothetical protein  47.25 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0026  LrgB-like family protein  47.25 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23092  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2682  hypothetical protein  47.25 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0027  LrgB-like family protein  47.25 
 
 		 240 aa  154  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0238  hypothetical protein  47.25 
 
 		 253 aa  154  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4337  LrgB family protein  41.55 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.4746  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0245  LrgB family protein  44.39 
 
 		 230 aa  148  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4609  LrgB family protein  42.54 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0900  LrgB-like protein  42.54 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1686  hypothetical protein  47.32 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795605  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0099  LrgB family protein  41.5 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0089  LrgB family protein  41 
 
 		 224 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0082  LrgB-like protein  40.5 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18459  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3778  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1536  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.020516 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0212  LrgB family protein  34.36 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3711  hypothetical protein  39.55 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.34067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3356  LrgB family protein  38.64 
 
 		 225 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.591604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3704  hypothetical protein  39.09 
 
 		 225 aa  132  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3459  hypothetical protein  39.09 
 
 		 225 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.807619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3425  murein hydrolase export regulator  39.09 
 
 		 225 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0481029  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3687  hypothetical protein  39.09 
 
 		 225 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353433 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3731  hypothetical protein  39.09 
 
 		 225 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3376  murein hydrolase export regulator  39.09 
 
 		 225 aa  131  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.508194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0707  LrgB family protein  33.85 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000904549  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4625  LrgB family protein  42.52 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4485  LrgB family protein  43.28 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6539  LrgB family protein  34.4 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.198287 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4924  LrgB family protein  30.74 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609983  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0819  LrgB family protein  37.25 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.061161  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4959  murein hydrolase export regulator  30 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0594327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4811  murein hydrolase export regulator  30 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.977744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4821  murein hydrolase export regulator  30 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0719494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5337  hypothetical protein  30 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.247434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5217  hypothetical protein  30 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5281  hypothetical protein  30 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000270926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5235  hypothetical protein  29.57 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3676  LrgB family protein  30.84 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000265737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5706  hypothetical protein  30 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3796  LrgB family protein  44.86 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2909  LrgB family protein  31.94 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  34.72 
 
 		 245 aa  119  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  35.38 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0853  hypothetical protein  33.67 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  35.38 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  39.26 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  39.26 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  34.43 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  34.43 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  29.49 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  32.44 
 
 		 245 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  26.36 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2405  LrgB family protein  34.72 
 
 		 241 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03101  LrgB-like protein  33.48 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0895138  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  31.02 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2977  LrgB family protein  34.26 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1497  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  33.33 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>