243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1229 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1229  LrgB-like family protein  100 
 
 		 240 aa  468  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1497  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2968  hypothetical protein  40 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45272  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  37.04 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  37.04 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  37.04 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  37.04 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  37.04 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  38.5 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  37.04 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  38.5 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  37.04 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  37.5 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  37.04 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  38.03 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  37.5 
 
 		 231 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  37.5 
 
 		 231 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  37.5 
 
 		 231 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  37.5 
 
 		 231 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2448  hypothetical protein  38.38 
 
 		 231 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  35.65 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1569  hypothetical protein  37.44 
 
 		 231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  35.48 
 
 		 238 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  36.49 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  36.49 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  36.49 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  36.15 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  33.79 
 
 		 236 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1096  hypothetical protein  34.12 
 
 		 236 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2543  hypothetical protein  39 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4980  LrgB-like protein  36.02 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1236  hypothetical protein  36.79 
 
 		 231 aa  135  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0736  hypothetical protein  34.27 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  33.94 
 
 		 245 aa  132  5e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02117  murein hydrolase export regulator  35.07 
 
 		 225 aa  132  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2765  hypothetical protein  36.61 
 
 		 231 aa  131  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  35.53 
 
 		 245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003698  lrgA-associated membrane protein LrgB  34.6 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0853  hypothetical protein  35.07 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0074  LrgB family protein  32.91 
 
 		 230 aa  128  8.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08310  membrane protein, LrgB family  32.86 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.298678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  37.37 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2907  LrgB family protein  29.68 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3808  LrgB family protein  33.02 
 
 		 238 aa  115  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  35.68 
 
 		 240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0021  LrgB family protein  33.49 
 
 		 233 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3765  hypothetical protein  31.34 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000370937 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1444  hypothetical protein  30.41 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000188634 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2563  hypothetical protein  31.36 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2616  hypothetical protein  31.36 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2740  LrgB family protein  34.67 
 
 		 238 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1268  LrgB family protein  34.34 
 
 		 244 aa  111  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0819  LrgB family protein  31.16 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.061161  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3855  hypothetical protein  29.95 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2116  hypothetical protein  32.16 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0001189  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2670  hypothetical protein  34.74 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.275457 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3676  LrgB family protein  29.73 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000265737  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0448  LrgB family protein  34.48 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2977  LrgB family protein  33.64 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3598  hypothetical protein  31.34 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.350738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3884  hypothetical protein  31.34 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  32.27 
 
 		 244 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0272  hypothetical protein  30.84 
 
 		 235 aa  108  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0267  hypothetical protein  30.14 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1318  LrgB family protein  31.05 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95009e-21 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2405  LrgB family protein  33.18 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0422  LrgB family protein  29.6 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3524  LrgB family protein  30.67 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0326  hypothetical protein  29.26 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568511  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  30.7 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0333  LrgB-like protein  34.85 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  31.2 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2209  LrgB family protein  30.66 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591035  normal  0.130625 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0342  hypothetical protein  29.26 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1322  LrgB family protein  30.14 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  32.73 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4959  murein hydrolase export regulator  30.18 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0594327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4811  murein hydrolase export regulator  30.18 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.977744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4821  murein hydrolase export regulator  30.18 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0719494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5337  hypothetical protein  30.18 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.247434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5217  hypothetical protein  30.18 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1607  LrgB-like protein  28.05 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.884781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  32.27 
 
 		 244 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1067  LrgB family protein  34.46 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00860  putative effector of murein hydrolase  29.58 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5706  hypothetical protein  29.73 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3735  LrgB family protein  32.42 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  31.6 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4924  LrgB family protein  29.73 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609983  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5281  hypothetical protein  29.73 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000270926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5235  hypothetical protein  29.28 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  35.44 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  31.28 
 
 		 238 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  33.82 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  32.34 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4337  LrgB family protein  25.89 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.4746  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  32.34 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0291  LrgB family protein  32.74 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1100  putative inner membrane protein yohK  33.18 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1954  LrgB family protein  34.87 
 
 		 239 aa  102  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>