191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_2540 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009355  OSTLU_2540  predicted protein  100 
 
 		 417 aa  805    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45887  predicted protein  32.66 
 
 		 524 aa  164  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12346  predicted protein  29.33 
 
 		 408 aa  143  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3993  LrgB family protein  27.31 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.479207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1577  LrgB family protein  34.07 
 
 		 230 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.4351e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003698  lrgA-associated membrane protein LrgB  34.39 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0212  LrgB family protein  32.52 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0666  LrgB family protein  29.41 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2906  LrgB family protein  27.71 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2500  LrgB family protein  27.71 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.541582 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1161  LrgB family protein  28.92 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2907  LrgB family protein  34.97 
 
 		 229 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1853  LrgB family protein  28.34 
 
 		 238 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1100  putative inner membrane protein yohK  27.04 
 
 		 240 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02117  murein hydrolase export regulator  31.85 
 
 		 225 aa  67  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2670  hypothetical protein  31.85 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.275457 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0747  LrgB family protein  29.63 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22940  conserved hypothetical protein TIGR00659  30.86 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1954  LrgB family protein  34.88 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1497  hypothetical protein  28.25 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2116  hypothetical protein  29.81 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0001189  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  30.13 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  26.61 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2027  antiholin-like protein LrgB  27.94 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.69711  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2427  LrgB-like protein  27.39 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2977  LrgB family protein  31.49 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0900  LrgB-like protein  31.98 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1359  LrgB family protein  26.84 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957145  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4609  LrgB family protein  31.18 
 
 		 228 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2405  LrgB family protein  31.49 
 
 		 241 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0623  LrgB-like protein  29.75 
 
 		 241 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3003  LrgB family protein  24.88 
 
 		 237 aa  62.4  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  27.98 
 
 		 231 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0248  antiholin-like protein LrgB  28.48 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0254  antiholin-like protein LrgB  28.48 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3283  LrgB family protein  26.67 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.381562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2448  hypothetical protein  27.68 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0546  LrgB family protein  27.92 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415827  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3576  putative transmembrane protein  36.07 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0853  hypothetical protein  31.06 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0333  LrgB-like protein  28.3 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2968  hypothetical protein  26.55 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45272  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  29.56 
 
 		 241 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  24.89 
 
 		 246 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0074  LrgB family protein  33.33 
 
 		 230 aa  59.3  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2740  LrgB family protein  31.53 
 
 		 238 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2563  hypothetical protein  26.14 
 
 		 229 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2616  hypothetical protein  26.14 
 
 		 229 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1695  hypothetical protein  28.89 
 
 		 228 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0422  LrgB family protein  31.69 
 
 		 231 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408547  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3928  LrgB family protein  27.55 
 
 		 238 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.337837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3937  LrgB family protein  28.57 
 
 		 238 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0021  LrgB family protein  25.14 
 
 		 233 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  33.59 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  25.16 
 
 		 240 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3644  LrgB family protein  28.57 
 
 		 238 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7210  putative murein hydrolase export regulator, LrgB family protein  30.34 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2543  hypothetical protein  28.14 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4625  LrgB family protein  32.87 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4485  LrgB family protein  32.19 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00860  putative effector of murein hydrolase  30.67 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19690  hypothetical protein  28.15 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67615  predicted protein  24.81 
 
 		 705 aa  57.4  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  26.15 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  26.15 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1318  LrgB family protein  34.97 
 
 		 229 aa  57  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95009e-21 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  26.15 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  26.15 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0492  LrgB-like protein  27.74 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  26.15 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  26.15 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  26.15 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2909  LrgB family protein  33.76 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0156  LrgB family protein  29.93 
 
 		 238 aa  57  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2209  LrgB family protein  26.11 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591035  normal  0.130625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0412  LrgB family protein  31.71 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.579768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  27.46 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  27.46 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3376  murein hydrolase export regulator  27.41 
 
 		 225 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.508194  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3711  hypothetical protein  27.41 
 
 		 225 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.34067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  26.49 
 
 		 231 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  24.46 
 
 		 244 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  28.8 
 
 		 231 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  27.68 
 
 		 231 aa  56.2  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1686  hypothetical protein  29.45 
 
 		 229 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3704  hypothetical protein  27.41 
 
 		 225 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3459  hypothetical protein  27.41 
 
 		 225 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.807619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3687  hypothetical protein  27.41 
 
 		 225 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353433 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3425  murein hydrolase export regulator  27.41 
 
 		 225 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0481029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1536  hypothetical protein  27.41 
 
 		 225 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.020516 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  24.89 
 
 		 244 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  29.56 
 
 		 239 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3731  hypothetical protein  27.41 
 
 		 225 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1607  LrgB-like protein  27.15 
 
 		 241 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.884781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  26.94 
 
 		 231 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  24.46 
 
 		 244 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3778  hypothetical protein  27.41 
 
 		 225 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0342  hypothetical protein  32 
 
 		 235 aa  55.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  28.88 
 
 		 231 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  28.8 
 
 		 231 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>