244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0212 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0212  LrgB family protein  100 
 
 		 237 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2907  LrgB family protein  46.32 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1318  LrgB family protein  48.4 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95009e-21 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1577  LrgB family protein  43.06 
 
 		 230 aa  168  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.4351e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0021  LrgB family protein  43.4 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  40.79 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  40.44 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  40 
 
 		 244 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  40.44 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  36.48 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  41.67 
 
 		 241 aa  141  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  40.89 
 
 		 246 aa  141  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  41.33 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  41.33 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1497  hypothetical protein  40.54 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  38.74 
 
 		 231 aa  138  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  41.92 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1607  LrgB-like protein  38.03 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.884781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  35.16 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  40.17 
 
 		 241 aa  135  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2968  hypothetical protein  40.83 
 
 		 232 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45272  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  40.28 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  38.74 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0819  LrgB family protein  36.87 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.061161  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  41.2 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  38.74 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  38.74 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  38.74 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  38.74 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  38.74 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  38.74 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  38.74 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  37.61 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  41.1 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00860  putative effector of murein hydrolase  35.65 
 
 		 234 aa  132  6e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0736  hypothetical protein  41.71 
 
 		 238 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1236  hypothetical protein  41.83 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1322  LrgB family protein  31.88 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  37.99 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  39.81 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  37.61 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  37.61 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  39.81 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  37.61 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  37.61 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1096  hypothetical protein  40.64 
 
 		 236 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08310  membrane protein, LrgB family  40.38 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.298678  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2448  hypothetical protein  38.39 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2909  LrgB family protein  39.42 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0342  hypothetical protein  35.45 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  39.81 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3808  LrgB family protein  41.82 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  37.5 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0830  LrgB family protein  34.43 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2236  lrgB-like family protein  36.41 
 
 		 236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3993  LrgB family protein  34.35 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.479207  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1948  lrgB-like family protein  35.94 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4980  LrgB-like protein  40.27 
 
 		 238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0422  LrgB family protein  34.55 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408547  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0666  LrgB family protein  36.49 
 
 		 238 aa  125  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0326  hypothetical protein  35 
 
 		 235 aa  125  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568511  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19690  hypothetical protein  33.82 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1954  LrgB family protein  38.43 
 
 		 239 aa  124  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4959  murein hydrolase export regulator  33.64 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0594327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4811  murein hydrolase export regulator  33.64 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.977744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4821  murein hydrolase export regulator  33.64 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0719494  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  37.16 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  37.32 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5217  hypothetical protein  33.64 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5337  hypothetical protein  33.64 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.247434  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0412  LrgB family protein  41.33 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.579768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  37.32 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1695  hypothetical protein  32.72 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3928  LrgB family protein  37.78 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.337837 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5281  hypothetical protein  33.18 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000270926  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1569  hypothetical protein  41.23 
 
 		 231 aa  122  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5706  hypothetical protein  33.18 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  36.84 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3676  LrgB family protein  32.71 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000265737  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0074  LrgB family protein  34.72 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0159  LrgB family protein  34.26 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2254  putative transmembrane protein  42.01 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2670  hypothetical protein  38.84 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.275457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1100  putative inner membrane protein yohK  34.93 
 
 		 240 aa  121  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1853  LrgB family protein  36.77 
 
 		 238 aa  121  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5235  hypothetical protein  32.7 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4924  LrgB family protein  32.71 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609983  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2977  LrgB family protein  40.28 
 
 		 241 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2116  hypothetical protein  31.03 
 
 		 229 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0001189  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1268  LrgB family protein  38.36 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2920  LrgB family protein  36.45 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0811  putative effector of murein hydrolase  33.03 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00607912  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2405  LrgB family protein  39.81 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4427  LrgB family protein  36.36 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113499  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2765  hypothetical protein  40.28 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7210  putative murein hydrolase export regulator, LrgB family protein  33.18 
 
 		 236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3283  LrgB family protein  38.32 
 
 		 240 aa  118  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.381562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2543  hypothetical protein  38.86 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  35.96 
 
 		 245 aa  118  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>