242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4609 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4609  LrgB family protein  100 
 
 		 228 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242093  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4625  LrgB family protein  98.25 
 
 		 228 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4485  LrgB family protein  98.65 
 
 		 223 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0900  LrgB-like protein  83.33 
 
 		 228 aa  338  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19690  hypothetical protein  68.86 
 
 		 228 aa  305  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1695  hypothetical protein  67.54 
 
 		 228 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0422  LrgB family protein  58.37 
 
 		 231 aa  262  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408547  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0342  hypothetical protein  57.47 
 
 		 235 aa  257  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0326  hypothetical protein  57.01 
 
 		 235 aa  254  9e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568511  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4337  LrgB family protein  52.94 
 
 		 231 aa  236  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.4746  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7210  putative murein hydrolase export regulator, LrgB family protein  54.88 
 
 		 236 aa  229  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0267  hypothetical protein  48.82 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0272  hypothetical protein  48.34 
 
 		 235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3796  LrgB family protein  54.59 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0089  LrgB family protein  50.49 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0099  LrgB family protein  50.49 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0082  LrgB-like protein  51.47 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18459  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0819  LrgB family protein  43.84 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.061161  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4616  LrgB family protein  42.11 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4532  lrgB-like family protein  42.11 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.889737  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4525  LrgB family protein  42.11 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4618  LrgB family protein  42.11 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2920  LrgB family protein  46.51 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4427  LrgB family protein  43.72 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113499  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4667  LrgB family protein  41.67 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0273  LrgB family protein  41.23 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0268732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0830  LrgB family protein  43.27 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2322  LrgB family protein  39.63 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000117788  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0034  LrgB family protein  43.72 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0043  LrgB family protein  43.72 
 
 		 240 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.690541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0028  LrgB-like protein  43.72 
 
 		 240 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0042  LrgB family protein  43.72 
 
 		 240 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0061  LrgB family protein  43.72 
 
 		 240 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0025  hypothetical protein  44.7 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216066  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1607  LrgB-like protein  42.52 
 
 		 241 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.884781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0045  LrgB family protein  43.72 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2767  hypothetical protein  44.7 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3499  hypothetical protein  44.7 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1870  hypothetical protein  44.7 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0027  LrgB-like family protein  44.7 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0026  LrgB-like family protein  44.7 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23092  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2682  hypothetical protein  44.7 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0238  hypothetical protein  44.7 
 
 		 253 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3226  LrgB-like protein  43.26 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.144978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3356  LrgB family protein  40.58 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.591604  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  41.1 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0892  LrgB family protein  41.23 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  40.36 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  40.81 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  40.36 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1686  hypothetical protein  44.39 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3711  hypothetical protein  39.61 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.34067  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3024  LrgB family protein  36.84 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0245  LrgB family protein  41.26 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  42.27 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1536  hypothetical protein  39.61 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.020516 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3778  hypothetical protein  39.61 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0976  LrgB family protein  37.56 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3704  hypothetical protein  39.13 
 
 		 225 aa  142  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0955  LrgB family protein  37.56 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3388  LrgB family protein  37.56 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0990  LrgB family protein  37.56 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3459  hypothetical protein  39.13 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.807619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3425  murein hydrolase export regulator  39.13 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0481029  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3687  hypothetical protein  39.13 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353433 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1322  LrgB family protein  34.12 
 
 		 232 aa  141  9e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3731  hypothetical protein  39.13 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  39.27 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  39.27 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6539  LrgB family protein  38.53 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.198287 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3376  murein hydrolase export regulator  38.65 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.508194  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3676  LrgB family protein  34.09 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000265737  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  39.04 
 
 		 240 aa  136  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  38.28 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  39.73 
 
 		 246 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  34.8 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1048  hypothetical protein  36.62 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0923  LrgB family protein  36.62 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.47828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0886  LrgB family protein  36.62 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00106123  normal  0.143935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2926  hypothetical protein  41.31 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000884331  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3049  LrgB family protein  36.62 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00126242  normal  0.0295055 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4924  LrgB family protein  32.73 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5235  hypothetical protein  32.73 
 
 		 230 aa  132  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4959  murein hydrolase export regulator  32.73 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0594327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4811  murein hydrolase export regulator  32.73 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.977744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4821  murein hydrolase export regulator  32.73 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0719494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5706  hypothetical protein  32.73 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5337  hypothetical protein  32.73 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.247434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5281  hypothetical protein  32.73 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000270926  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5217  hypothetical protein  32.73 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  38.18 
 
 		 241 aa  131  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2236  lrgB-like family protein  33.94 
 
 		 236 aa  131  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1948  lrgB-like family protein  33.48 
 
 		 236 aa  131  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2448  hypothetical protein  35.05 
 
 		 231 aa  131  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00860  putative effector of murein hydrolase  31.94 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3735  LrgB family protein  38.26 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0128  LrgB family protein  35.89 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  32.24 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  35.24 
 
 		 245 aa  128  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>