235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12346 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_12346  predicted protein  100 
 
 		 408 aa  795    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45887  predicted protein  41.95 
 
 		 524 aa  292  7e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2540  predicted protein  27.29 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  31.22 
 
 		 239 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2907  LrgB family protein  29.34 
 
 		 229 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1359  LrgB family protein  29.15 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957145  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1577  LrgB family protein  31.43 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.4351e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0412  LrgB family protein  32.47 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.579768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19690  hypothetical protein  34.56 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1268  LrgB family protein  34.43 
 
 		 244 aa  75.5  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  29.59 
 
 		 239 aa  75.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  33.97 
 
 		 244 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  36.36 
 
 		 240 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  33.97 
 
 		 244 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22940  conserved hypothetical protein TIGR00659  30.56 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0254  antiholin-like protein LrgB  30.92 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0248  antiholin-like protein LrgB  30.92 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  27.32 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003698  lrgA-associated membrane protein LrgB  29.56 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2027  antiholin-like protein LrgB  29.49 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.69711  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0736  hypothetical protein  30.19 
 
 		 238 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1695  hypothetical protein  33.82 
 
 		 228 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  26.57 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0623  LrgB-like protein  30.22 
 
 		 241 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0128  LrgB family protein  29.53 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  24.88 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1794  LrgB-like protein  28.29 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  29.56 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03101  LrgB-like protein  27.78 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0895138  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3928  LrgB family protein  31.31 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.337837 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0707  LrgB family protein  26.23 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000904549  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67615  predicted protein  27.03 
 
 		 705 aa  70.9  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0819  LrgB family protein  32.82 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.061161  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1954  LrgB family protein  31.64 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0853  hypothetical protein  28.93 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1853  LrgB family protein  31.46 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02117  murein hydrolase export regulator  28.3 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1010  LrgB family protein  29.71 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  25.6 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  25.6 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  28.11 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1686  hypothetical protein  33.79 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795605  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3937  LrgB family protein  29.86 
 
 		 238 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  32.73 
 
 		 240 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0666  LrgB family protein  32.39 
 
 		 238 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  31.41 
 
 		 244 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3644  LrgB family protein  29.86 
 
 		 238 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3993  LrgB family protein  34.38 
 
 		 239 aa  69.7  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.479207  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  32.05 
 
 		 244 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1318  LrgB family protein  28.57 
 
 		 229 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95009e-21 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00860  putative effector of murein hydrolase  27.69 
 
 		 234 aa  68.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  31.41 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4980  LrgB-like protein  28.93 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  31.41 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2543  hypothetical protein  30.46 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2427  LrgB-like protein  29.61 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0342  hypothetical protein  31.25 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0422  LrgB family protein  28.8 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408547  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0546  LrgB family protein  31.98 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1236  hypothetical protein  29.41 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0291  LrgB family protein  30.9 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3283  LrgB family protein  31.52 
 
 		 240 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.381562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  32.95 
 
 		 241 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2405  LrgB family protein  27.23 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1569  hypothetical protein  27.85 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1949  LrgB family protein  30.46 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7210  putative murein hydrolase export regulator, LrgB family protein  32.84 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1536  hypothetical protein  30.29 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.020516 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3778  hypothetical protein  30.29 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2448  hypothetical protein  28.74 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3704  hypothetical protein  30.29 
 
 		 225 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3459  hypothetical protein  30.29 
 
 		 225 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.807619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3425  murein hydrolase export regulator  30.29 
 
 		 225 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0481029  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  31.91 
 
 		 231 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3376  murein hydrolase export regulator  30.29 
 
 		 225 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.508194  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3731  hypothetical protein  30.29 
 
 		 225 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3687  hypothetical protein  30.29 
 
 		 225 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353433 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2977  LrgB family protein  24.64 
 
 		 241 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  31.91 
 
 		 231 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3735  LrgB family protein  31.03 
 
 		 239 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3388  LrgB family protein  29.86 
 
 		 238 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  30.19 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3356  LrgB family protein  29.14 
 
 		 225 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.591604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3711  hypothetical protein  30.29 
 
 		 225 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.34067  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0272  hypothetical protein  28.25 
 
 		 235 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3003  LrgB family protein  30.05 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  31.91 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1607  LrgB-like protein  25.64 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.884781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  31.21 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0326  hypothetical protein  30.56 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568511  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  27.22 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  27.22 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  27.22 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  27.88 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  27.22 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  27.22 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  27.22 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  27.22 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4609  LrgB family protein  29.11 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0021  LrgB family protein  23.39 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>