242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0028 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0028  LrgB-like protein  100 
 
 
240 aa  470  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0042  LrgB family protein  100 
 
 
240 aa  470  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0061  LrgB family protein  99.58 
 
 
240 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775871  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3226  LrgB-like protein  96.25 
 
 
240 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.144978 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0045  LrgB family protein  95.83 
 
 
240 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0043  LrgB family protein  95.42 
 
 
240 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.690541  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0034  LrgB family protein  95 
 
 
240 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0025  hypothetical protein  85.46 
 
 
240 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2767  hypothetical protein  85.02 
 
 
240 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3499  hypothetical protein  85.02 
 
 
240 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1870  hypothetical protein  85.02 
 
 
240 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0027  LrgB-like family protein  85.02 
 
 
240 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0026  LrgB-like family protein  85.02 
 
 
240 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23092  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2682  hypothetical protein  85.02 
 
 
240 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0238  hypothetical protein  85.02 
 
 
253 aa  352  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2920  LrgB family protein  74.58 
 
 
240 aa  329  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4427  LrgB family protein  53.42 
 
 
229 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113499  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1607  LrgB-like protein  50.93 
 
 
241 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.884781  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4525  LrgB family protein  50 
 
 
229 aa  214  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4532  lrgB-like family protein  50 
 
 
229 aa  214  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.889737  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4618  LrgB family protein  50 
 
 
229 aa  214  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4616  LrgB family protein  50 
 
 
229 aa  214  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0273  LrgB family protein  49.33 
 
 
229 aa  214  8e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0268732  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4667  LrgB family protein  49.55 
 
 
229 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1686  hypothetical protein  54.11 
 
 
229 aa  201  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795605  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4337  LrgB family protein  48.89 
 
 
231 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.4746  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0422  LrgB family protein  49.76 
 
 
231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408547  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1322  LrgB family protein  42.2 
 
 
232 aa  189  4e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0342  hypothetical protein  47.39 
 
 
235 aa  188  7e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0272  hypothetical protein  48.53 
 
 
235 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0830  LrgB family protein  51.42 
 
 
229 aa  186  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0267  hypothetical protein  48.04 
 
 
235 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0326  hypothetical protein  46.96 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7210  putative murein hydrolase export regulator, LrgB family protein  47.39 
 
 
236 aa  175  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19690  hypothetical protein  44.55 
 
 
228 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0990  LrgB family protein  45.78 
 
 
239 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0976  LrgB family protein  45.78 
 
 
239 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0955  LrgB family protein  45.78 
 
 
239 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3388  LrgB family protein  45.78 
 
 
239 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1695  hypothetical protein  44.08 
 
 
228 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0245  LrgB family protein  43.81 
 
 
230 aa  167  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3024  LrgB family protein  44.44 
 
 
239 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0923  LrgB family protein  47.62 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.47828  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0886  LrgB family protein  47.62 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00106123  normal  0.143935 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3049  LrgB family protein  47.14 
 
 
244 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00126242  normal  0.0295055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4609  LrgB family protein  43.72 
 
 
228 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242093  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1048  hypothetical protein  47.62 
 
 
244 aa  161  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0900  LrgB-like protein  42.92 
 
 
228 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0819  LrgB family protein  40.38 
 
 
224 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.061161  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3796  LrgB family protein  48.82 
 
 
240 aa  152  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2322  LrgB family protein  39.53 
 
 
225 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000117788  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0082  LrgB-like protein  43.81 
 
 
224 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18459  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0892  LrgB family protein  43.56 
 
 
229 aa  149  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6539  LrgB family protein  37.91 
 
 
226 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.198287 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0099  LrgB family protein  43.3 
 
 
224 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0089  LrgB family protein  43.3 
 
 
224 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4485  LrgB family protein  44.06 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4625  LrgB family protein  43.56 
 
 
228 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669725  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2926  hypothetical protein  46.67 
 
 
229 aa  144  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000884331  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3778  hypothetical protein  39.61 
 
 
225 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1536  hypothetical protein  39.61 
 
 
225 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.020516 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3356  LrgB family protein  38.65 
 
 
225 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.591604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3376  murein hydrolase export regulator  39.13 
 
 
225 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.508194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3704  hypothetical protein  39.13 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3687  hypothetical protein  39.13 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353433 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3459  hypothetical protein  39.13 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.807619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3425  murein hydrolase export regulator  39.13 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0481029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3731  hypothetical protein  39.13 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3711  hypothetical protein  39.13 
 
 
225 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.34067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  37.74 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  37.74 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  37.74 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  37.74 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  37.26 
 
 
231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  37.74 
 
 
231 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  36.32 
 
 
231 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.640575 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  36.32 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  36.32 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  36.32 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  36.32 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  36.32 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  36.32 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  36.32 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2968  hypothetical protein  35.38 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45272  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0903  LrgB family protein  46.76 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000464548 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  37.09 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1497  hypothetical protein  34.91 
 
 
231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  33.96 
 
 
231 aa  128  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  33.96 
 
 
231 aa  128  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1569  hypothetical protein  36.32 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  33.49 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  38.8 
 
 
240 aa  126  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  36.32 
 
 
241 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1236  hypothetical protein  36.95 
 
 
231 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2448  hypothetical protein  35.85 
 
 
231 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5235  hypothetical protein  30.49 
 
 
230 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3676  LrgB family protein  29.6 
 
 
230 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000265737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4821  murein hydrolase export regulator  30.49 
 
 
230 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0719494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5337  hypothetical protein  30.49 
 
 
230 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.247434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5217  hypothetical protein  30.49 
 
 
230 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>