265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39523 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_39523  predicted protein  100 
 
 		 392 aa  817    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35457  transcriptional regulatory protein  27.27 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0738163  normal  0.450522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  35 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  32.86 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  36.88 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1797  NAD-dependent deacetylase  35.82 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0401788  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3622  NAD-dependent deacetylase  26.35 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4461  NAD-dependent deacetylase  26.35 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3905  NAD-dependent deacetylase  26.35 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  36.5 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  32.37 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0629  NAD-dependent deacetylase  25.94 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.289592  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2501  NAD-dependent deacetylase  34.33 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000275677  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1843  NAD-dependent deacetylase  34.33 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000585877  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2621  NAD-dependent deacetylase  34.33 
 
 		 243 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000617513  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2508  NAD-dependent deacetylase  34.33 
 
 		 243 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000926732  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  30.38 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21543  predicted protein  25 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1938  NAD-dependent deacetylase  35.07 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  36.36 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  33.58 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2183  NAD-dependent deacetylase  25.18 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.622873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  36.36 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  36.36 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  31.43 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  32.35 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  24.62 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2055  NAD-dependent deacetylase  32.17 
 
 		 238 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0387901  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5448  Silent information regulator protein Sir2  30 
 
 		 229 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  32.35 
 
 		 276 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  35.61 
 
 		 235 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3799  NAD-dependent deacetylase  25.63 
 
 		 298 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.577483 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0217  Silent information regulator protein Sir2  26.39 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  33.33 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0210  NAD-dependent deacetylase  24.57 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.994892 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  33.33 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  30.5 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  33.33 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  33.33 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  33.33 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  28.67 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1642  NAD-dependent deacetylase  33.58 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1717  NAD-dependent deacetylase  33.58 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000104436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  35.04 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  32.14 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  33.33 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  33.33 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  32.84 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07461  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05900)  32.33 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.12277 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  32.35 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  30.56 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1717  NAD-dependent deacetylase  33.58 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000712347  normal  0.253477 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1781  NAD-dependent deacetylase  28.17 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0004  NAD-dependent deacetylase  32 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0079912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0294  Silent information regulator protein Sir2  29.85 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  29.37 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  32.67 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  30.71 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  34.85 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  33.1 
 
 		 273 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  33.1 
 
 		 273 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  33.1 
 
 		 273 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  30.56 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  34.09 
 
 		 243 aa  57  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  33.1 
 
 		 273 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  33.1 
 
 		 273 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16771  predicted protein  32.61 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0241463 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3283  NAD-dependent deacetylase  26.67 
 
 		 298 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  30.56 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  30.56 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  28.4 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  32.19 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  30.56 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  30.56 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  34.85 
 
 		 243 aa  55.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2843  NAD-dependent deacetylase  30.94 
 
 		 245 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  30.94 
 
 		 245 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  30.56 
 
 		 241 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  30.22 
 
 		 245 aa  56.2  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  30.56 
 
 		 242 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4712  silent information regulator protein Sir2  25.34 
 
 		 295 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  0.0150629 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03769  NAD-dependent deacetylase  23.71 
 
 		 293 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  31.41 
 
 		 264 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  30.71 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  31.34 
 
 		 258 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1968  Silent information regulator protein Sir2  31.25 
 
 		 229 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00937822  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  31.06 
 
 		 244 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  34.03 
 
 		 273 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  30.15 
 
 		 256 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1594  NAD-dependent deacetylase  32.09 
 
 		 253 aa  54.3  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000756784  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  32.09 
 
 		 240 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12305  predicted protein  31.29 
 
 		 303 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  28.12 
 
 		 251 aa  54.7  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  32.06 
 
 		 232 aa  53.9  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  28.57 
 
 		 235 aa  53.9  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  32.33 
 
 		 242 aa  53.9  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  29.53 
 
 		 243 aa  53.1  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2461  silent information regulator protein Sir2  25.44 
 
 		 306 aa  53.1  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>