31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2129 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  99.35 
 
 		 463 aa  922    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  925    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  59.12 
 
 		 474 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  56.04 
 
 		 463 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  55.82 
 
 		 463 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0414  hypothetical protein  48.73 
 
 		 520 aa  452  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.103112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  42.33 
 
 		 498 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26391  hypothetical protein  34.87 
 
 		 470 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2371  hypothetical protein  32.63 
 
 		 482 aa  217  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0320  hypothetical protein  32.37 
 
 		 465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.935671  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1991  membrane protein-like protein  31.48 
 
 		 447 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.975247  normal  0.0103529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4272  membrane protein-like protein  25.44 
 
 		 478 aa  93.2  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4049  hypothetical protein  26.04 
 
 		 541 aa  86.7  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  25 
 
 		 481 aa  86.7  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0853  membrane protein-like protein  28.45 
 
 		 579 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1179  hypothetical protein  24.07 
 
 		 509 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3886  membrane protein-like protein  27.84 
 
 		 586 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.920923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0720  hypothetical protein  24.89 
 
 		 562 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1336  membrane protein-like protein  21.29 
 
 		 785 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7352  putative integral membrane protein  27.06 
 
 		 563 aa  63.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1526  hypothetical protein  24.01 
 
 		 546 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  22.91 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08120  predicted membrane protein  25.76 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2573  hypothetical protein  23.21 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  24.26 
 
 		 525 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5205  membrane protein-like protein  27.59 
 
 		 521 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0753  membrane protein-like protein  28.44 
 
 		 659 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.844921  normal  0.0837231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4411  membrane protein-like protein  27.27 
 
 		 663 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0414403  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5084  hypothetical protein  27.7 
 
 		 506 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108071  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1992  hypothetical protein  28.5 
 
 		 283 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00396912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0363  membrane protein-like  27.5 
 
 		 486 aa  50.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115908  normal  0.868887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>