23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2573 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2573  hypothetical protein  100 
 
 		 489 aa  976    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  35.38 
 
 		 525 aa  186  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08120  predicted membrane protein  42.86 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7352  putative integral membrane protein  31.76 
 
 		 563 aa  173  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  31.08 
 
 		 489 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2911  hypothetical protein  32.93 
 
 		 494 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal  0.0308568 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0363  membrane protein-like  31.71 
 
 		 486 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115908  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1346  Protein of unknown function DUF2079, membrane  32.9 
 
 		 509 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001004 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5205  membrane protein-like protein  33.47 
 
 		 521 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  30.98 
 
 		 481 aa  122  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5084  hypothetical protein  26.61 
 
 		 506 aa  94  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108071  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0371  membrane protein-like  41.07 
 
 		 476 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2371  hypothetical protein  27.74 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0753  membrane protein-like protein  26.19 
 
 		 659 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.844921  normal  0.0837231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  22.92 
 
 		 498 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  23.43 
 
 		 463 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1991  membrane protein-like protein  31.25 
 
 		 447 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.975247  normal  0.0103529 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  23.17 
 
 		 463 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0320  hypothetical protein  25.44 
 
 		 465 aa  49.3  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.935671  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4272  membrane protein-like protein  24.69 
 
 		 478 aa  47  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4049  hypothetical protein  24.32 
 
 		 541 aa  47  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  22.05 
 
 		 474 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  21.71 
 
 		 463 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>