16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0320 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0320  hypothetical protein  100 
 
 
465 aa  915    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.935671  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2371  hypothetical protein  68.53 
 
 
482 aa  566  1e-160  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26391  hypothetical protein  55.29 
 
 
470 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0414  hypothetical protein  32.2 
 
 
520 aa  232  9e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.103112  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  32.38 
 
 
474 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  32.37 
 
 
463 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  32.14 
 
 
463 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  30.7 
 
 
463 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  30.7 
 
 
463 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  27.94 
 
 
498 aa  151  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1991  membrane protein-like protein  40.6 
 
 
447 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.975247  normal  0.0103529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  25.48 
 
 
489 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2573  hypothetical protein  24.94 
 
 
489 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4411  membrane protein-like protein  24.76 
 
 
663 aa  47  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0414403  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0753  membrane protein-like protein  27.2 
 
 
659 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.844921  normal  0.0837231 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  27.03 
 
 
481 aa  45.1  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>