25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0414 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0414  hypothetical protein  100 
 
 
520 aa  1053    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.103112  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  53.73 
 
 
474 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  48.41 
 
 
498 aa  473  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  50.42 
 
 
463 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  50 
 
 
463 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  48.52 
 
 
463 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  48.73 
 
 
463 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26391  hypothetical protein  34.72 
 
 
470 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0320  hypothetical protein  32.2 
 
 
465 aa  227  4e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.935671  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2371  hypothetical protein  32.96 
 
 
482 aa  206  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3886  membrane protein-like protein  23.53 
 
 
586 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.920923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1991  membrane protein-like protein  32.42 
 
 
447 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.975247  normal  0.0103529 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0853  membrane protein-like protein  25.24 
 
 
579 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691101  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4272  membrane protein-like protein  24.27 
 
 
478 aa  87.8  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1336  membrane protein-like protein  26.1 
 
 
785 aa  79.3  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0753  membrane protein-like protein  23.55 
 
 
659 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.844921  normal  0.0837231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4411  membrane protein-like protein  26.61 
 
 
663 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0414403  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1179  hypothetical protein  22.26 
 
 
509 aa  59.7  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5205  membrane protein-like protein  29.13 
 
 
521 aa  57.4  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  26.29 
 
 
525 aa  55.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5084  hypothetical protein  27.46 
 
 
506 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108071  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7352  putative integral membrane protein  26.52 
 
 
563 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33063 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  22.33 
 
 
481 aa  48.9  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4049  hypothetical protein  21.14 
 
 
541 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0720  hypothetical protein  22.32 
 
 
562 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>