24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0853 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0853  membrane protein-like protein  100 
 
 		 579 aa  1153    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3886  membrane protein-like protein  84.15 
 
 		 586 aa  863    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.920923 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4272  membrane protein-like protein  29.83 
 
 		 478 aa  177  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0414  hypothetical protein  25.9 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.103112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  22.05 
 
 		 463 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  22.48 
 
 		 474 aa  94.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  22.37 
 
 		 463 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1526  hypothetical protein  25.23 
 
 		 546 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4049  hypothetical protein  25.51 
 
 		 541 aa  83.6  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  27.98 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  27.7 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  23.22 
 
 		 498 aa  81.3  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1336  membrane protein-like protein  23.37 
 
 		 785 aa  68.2  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0720  hypothetical protein  28 
 
 		 562 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1179  hypothetical protein  26.4 
 
 		 509 aa  58.2  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26411  hypothetical protein  25.26 
 
 		 542 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  27.06 
 
 		 489 aa  54.3  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0753  membrane protein-like protein  26.38 
 
 		 659 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.844921  normal  0.0837231 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  28.36 
 
 		 481 aa  52.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  26.54 
 
 		 525 aa  51.6  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1992  hypothetical protein  28.93 
 
 		 283 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00396912 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2911  hypothetical protein  26.64 
 
 		 494 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal  0.0308568 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0322  hypothetical protein  25.64 
 
 		 548 aa  45.8  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5205  membrane protein-like protein  28.89 
 
 		 521 aa  46.2  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>