24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0415 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  100 
 
 
498 aa  999    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0414  hypothetical protein  48.41 
 
 
520 aa  473  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.103112  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  45.58 
 
 
474 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  44.58 
 
 
463 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  44.58 
 
 
463 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  42.33 
 
 
463 aa  359  5e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  42.13 
 
 
463 aa  358  9e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26391  hypothetical protein  30.22 
 
 
470 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0320  hypothetical protein  27.94 
 
 
465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.935671  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2371  hypothetical protein  27.27 
 
 
482 aa  142  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1991  membrane protein-like protein  32.23 
 
 
447 aa  93.6  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.975247  normal  0.0103529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4272  membrane protein-like protein  25.15 
 
 
478 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  25 
 
 
481 aa  65.9  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3886  membrane protein-like protein  23.93 
 
 
586 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.920923 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0853  membrane protein-like protein  22.85 
 
 
579 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691101  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2573  hypothetical protein  22.45 
 
 
489 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4411  membrane protein-like protein  28.17 
 
 
663 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0414403  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0753  membrane protein-like protein  26.61 
 
 
659 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.844921  normal  0.0837231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5205  membrane protein-like protein  30.74 
 
 
521 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7352  putative integral membrane protein  28.45 
 
 
563 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33063 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1179  hypothetical protein  23.11 
 
 
509 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  25.65 
 
 
525 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  23.32 
 
 
489 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5084  hypothetical protein  27.23 
 
 
506 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108071  normal  0.201189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>